15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SAG0312 on replicon NC_004116
Organism: Streptococcus agalactiae 2603V/R



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  100 
 
 
234 aa  472  1e-132  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  26.67 
 
 
334 aa  68.6  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  27.81 
 
 
227 aa  57  0.0000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  29.51 
 
 
193 aa  55.8  0.0000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  27.47 
 
 
194 aa  54.7  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  28.57 
 
 
188 aa  51.2  0.00001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  26.52 
 
 
202 aa  48.9  0.00006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  25.87 
 
 
194 aa  45.8  0.0006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  22.92 
 
 
218 aa  45.4  0.0007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  23.14 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  30.61 
 
 
210 aa  43.9  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  26.32 
 
 
268 aa  44.3  0.002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  25.44 
 
 
206 aa  42.7  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  22.03 
 
 
190 aa  42  0.008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  24.59 
 
 
203 aa  41.6  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>