48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_2628 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 191 aa  382  1e-105  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  94.24 
 
 		 191 aa  343  7e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  79.57 
 
 		 191 aa  308  2.9999999999999997e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  65.61 
 
 		 191 aa  256  2e-67  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  60.53 
 
 		 194 aa  234  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  55.38 
 
 		 194 aa  226  1e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  61.9 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  61.9 
 
 		 193 aa  226  2e-58  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  57.07 
 
 		 205 aa  224  4e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  55.61 
 
 		 193 aa  221  7e-57  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  59.36 
 
 		 190 aa  217  7e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  57.75 
 
 		 190 aa  198  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  52.53 
 
 		 203 aa  197  7.999999999999999e-50  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  46.56 
 
 		 199 aa  192  3e-48  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  57.22 
 
 		 190 aa  182  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  34.55 
 
 		 188 aa  121  6e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  42.98 
 
 		 199 aa  103  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  41.23 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  40.48 
 
 		 205 aa  85.9  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  28.47 
 
 		 218 aa  70.9  0.00000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  31.07 
 
 		 218 aa  69.3  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  28.49 
 
 		 206 aa  68.2  0.00000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39 
 
 		 212 aa  67  0.0000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  36.89 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.55 
 
 		 208 aa  67  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  28.4 
 
 		 193 aa  65.5  0.0000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  31.76 
 
 		 200 aa  65.5  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.15 
 
 		 216 aa  62.4  0.000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  30.77 
 
 		 202 aa  62  0.000000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  29.6 
 
 		 219 aa  58.2  0.00000008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  28.09 
 
 		 215 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 		 334 aa  56.6  0.0000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  33.33 
 
 		 295 aa  55.8  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  34 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.29 
 
 		 239 aa  54.3  0.0000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  25.17 
 
 		 172 aa  53.9  0.000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  26.98 
 
 		 210 aa  53.9  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  33.06 
 
 		 211 aa  52.8  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  35.48 
 
 		 210 aa  51.2  0.000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  35.21 
 
 		 215 aa  50.1  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  31.21 
 
 		 206 aa  50.1  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.73 
 
 		 208 aa  49.3  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  37.84 
 
 		 229 aa  48.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0938  integral membrane protein  26.09 
 
 		 227 aa  46.2  0.0003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000154072  normal  0.402272 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  28.32 
 
 		 197 aa  45.8  0.0004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  40.58 
 
 		 210 aa  45.8  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  26.26 
 
 		 204 aa  44.3  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0312  hypothetical protein  28 
 
 		 234 aa  41.6  0.007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.904588  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>