44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3367 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  100 
 
 		 239 aa  480  1e-135  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  84.58 
 
 		 229 aa  323  2e-87  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  34.55 
 
 		 200 aa  106  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  34.03 
 
 		 205 aa  92.8  5e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  30.92 
 
 		 202 aa  86.7  3e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  32.32 
 
 		 208 aa  86.3  4e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  27.81 
 
 		 206 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  26.6 
 
 		 210 aa  77.8  0.0000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  29.95 
 
 		 219 aa  73.2  0.000000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  33.12 
 
 		 206 aa  72.8  0.000000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  26.64 
 
 		 216 aa  72  0.000000000008  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  35.59 
 
 		 212 aa  69.3  0.00000000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  29.47 
 
 		 268 aa  67.4  0.0000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  28.19 
 
 		 218 aa  65.5  0.0000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  30 
 
 		 205 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  23.11 
 
 		 220 aa  65.1  0.0000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  30.25 
 
 		 201 aa  64.7  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  32.14 
 
 		 210 aa  63.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.34 
 
 		 208 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  26.8 
 
 		 194 aa  60.5  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  26.37 
 
 		 193 aa  60.1  0.00000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  29.53 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  29.63 
 
 		 191 aa  59.3  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  25.64 
 
 		 204 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  25.68 
 
 		 211 aa  56.2  0.0000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 		 199 aa  55.5  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  24.04 
 
 		 295 aa  54.7  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  28.12 
 
 		 194 aa  54.7  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  30.89 
 
 		 191 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  39.36 
 
 		 203 aa  54.3  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.6 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.6 
 
 		 193 aa  53.5  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  26.46 
 
 		 190 aa  53.1  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  28.95 
 
 		 191 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  26.15 
 
 		 199 aa  52.8  0.000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  30.37 
 
 		 191 aa  52.8  0.000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  34 
 
 		 215 aa  52  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  30.61 
 
 		 215 aa  49.3  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  26.46 
 
 		 190 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  26 
 
 		 188 aa  48.5  0.00008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  24.56 
 
 		 195 aa  48.5  0.00009  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  28.04 
 
 		 190 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  24.53 
 
 		 334 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  26.12 
 
 		 201 aa  41.6  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>