33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5128 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  399  9.999999999999999e-111  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  45.66 
 
 		 190 aa  139  3e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  44.39 
 
 		 200 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  44.57 
 
 		 201 aa  125  6e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  28.79 
 
 		 206 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  30.89 
 
 		 212 aa  59.7  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  30.5 
 
 		 205 aa  59.7  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  28.36 
 
 		 268 aa  58.2  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  28.26 
 
 		 204 aa  55.5  0.0000005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  35.79 
 
 		 202 aa  52.8  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  28.35 
 
 		 210 aa  52.4  0.000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  28.15 
 
 		 219 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  26.42 
 
 		 220 aa  51.2  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  34.09 
 
 		 211 aa  50.1  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.37 
 
 		 216 aa  49.7  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  29.91 
 
 		 210 aa  49.3  0.00004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  29.57 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  26.32 
 
 		 193 aa  47.8  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  32.79 
 
 		 199 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  27.52 
 
 		 194 aa  47  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  24.56 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  26.87 
 
 		 190 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  24.19 
 
 		 295 aa  43.9  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  29.41 
 
 		 191 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  26.36 
 
 		 203 aa  43.9  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  34.72 
 
 		 215 aa  42.7  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  26.12 
 
 		 239 aa  42  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  25.61 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  25.61 
 
 		 193 aa  41.6  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  29.1 
 
 		 208 aa  41.6  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  26.55 
 
 		 218 aa  42  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  25.56 
 
 		 188 aa  41.6  0.009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  28.32 
 
 		 201 aa  41.6  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>