17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_2666 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  411  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  81.5 
 
 		 200 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  79.26 
 
 		 190 aa  318  3.9999999999999996e-86  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  44.57 
 
 		 201 aa  144  1e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  31.43 
 
 		 202 aa  55.1  0.0000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  34.07 
 
 		 211 aa  52  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  28.47 
 
 		 206 aa  50.8  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  24.43 
 
 		 205 aa  49.7  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  31.58 
 
 		 210 aa  46.2  0.0003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  27.12 
 
 		 194 aa  44.3  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  26.38 
 
 		 204 aa  43.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  25.13 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  25.19 
 
 		 268 aa  43.1  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  25.12 
 
 		 216 aa  42.4  0.005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  25.29 
 
 		 199 aa  42  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  20.93 
 
 		 219 aa  41.2  0.01  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  23.88 
 
 		 239 aa  41.2  0.01  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>