19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2702 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  86.17 
 
 		 190 aa  341  5e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  81.5 
 
 		 201 aa  323  8.000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  44.39 
 
 		 201 aa  144  8.000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  31.09 
 
 		 202 aa  55.5  0.0000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  26.72 
 
 		 205 aa  53.1  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  33.58 
 
 		 211 aa  52.8  0.000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  35.79 
 
 		 210 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  29.93 
 
 		 206 aa  49.7  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  25.47 
 
 		 216 aa  48.1  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  22.9 
 
 		 219 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  27.97 
 
 		 194 aa  45.4  0.0005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  26.2 
 
 		 212 aa  43.5  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  24.75 
 
 		 295 aa  42.7  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  27.01 
 
 		 268 aa  42.7  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  22.48 
 
 		 239 aa  42  0.006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  26.9 
 
 		 204 aa  42  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  31.09 
 
 		 194 aa  42  0.007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  31.53 
 
 		 208 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>