14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_3101 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 190 aa  388  1e-107  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2702  hypothetical protein  86.17 
 
 		 200 aa  323  1e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.291877  normal  0.197745 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2666  hypothetical protein  79.26 
 
 		 201 aa  300  1e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.768262  normal  0.119499 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  45.66 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  28.47 
 
 		 205 aa  50.8  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  29.41 
 
 		 206 aa  48.5  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  30.39 
 
 		 202 aa  48.5  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  24.24 
 
 		 219 aa  47.4  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  30.5 
 
 		 211 aa  47.8  0.0001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  27.14 
 
 		 216 aa  47  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  32.26 
 
 		 210 aa  44.7  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  25.62 
 
 		 199 aa  43.9  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  26.92 
 
 		 194 aa  42  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  27.21 
 
 		 268 aa  41.6  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>