26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_2298 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 201 aa  386  1e-106  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  41.04 
 
 		 214 aa  85.1  6e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  38.57 
 
 		 202 aa  76.6  0.0000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  39.37 
 
 		 206 aa  76.3  0.0000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  30.88 
 
 		 206 aa  75.9  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  34.36 
 
 		 218 aa  75.1  0.0000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  38.68 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  30.25 
 
 		 239 aa  64.3  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  33.96 
 
 		 268 aa  62.8  0.000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39.05 
 
 		 212 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  32.16 
 
 		 215 aa  59.7  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  29.79 
 
 		 220 aa  58.9  0.00000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  34.62 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  30.08 
 
 		 229 aa  54.3  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  29.48 
 
 		 208 aa  52.4  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  33.87 
 
 		 210 aa  52  0.000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  36.28 
 
 		 215 aa  51.6  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  30.53 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  37.36 
 
 		 211 aa  49.3  0.00004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  27.23 
 
 		 205 aa  48.1  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  28.16 
 
 		 188 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  34.4 
 
 		 200 aa  47.8  0.0001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  23.32 
 
 		 193 aa  44.3  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  34.34 
 
 		 295 aa  44.7  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.25 
 
 		 216 aa  42.7  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  35.64 
 
 		 205 aa  42.4  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>