46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_3607 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  100 
 
 
229 aa  459  9.999999999999999e-129  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  84.58 
 
 
239 aa  370  1e-101  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  35.08 
 
 
200 aa  108  8.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  34.03 
 
 
205 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.96 
 
 
208 aa  81.6  0.000000000000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  30.15 
 
 
202 aa  80.1  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  26.87 
 
 
210 aa  78.2  0.0000000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  37.61 
 
 
212 aa  77.8  0.0000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  27.5 
 
 
206 aa  77  0.0000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  31.75 
 
 
206 aa  76.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  29.9 
 
 
216 aa  74.7  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  30.11 
 
 
268 aa  69.7  0.00000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  30.48 
 
 
219 aa  70.1  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  29.23 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  30.95 
 
 
210 aa  67.8  0.0000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  28.02 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  34.45 
 
 
218 aa  63.9  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  27.32 
 
 
193 aa  63.2  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  27.35 
 
 
220 aa  62.4  0.000000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3960  protein of unknown function DUF1211  28.19 
 
 
208 aa  62  0.000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  30.33 
 
 
201 aa  61.6  0.000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  29.02 
 
 
210 aa  61.2  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  35.42 
 
 
199 aa  60.8  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  26.9 
 
 
211 aa  59.7  0.00000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  35.71 
 
 
203 aa  57.8  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  27.08 
 
 
190 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.6 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.6 
 
 
193 aa  58.2  0.0000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  28.12 
 
 
191 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  25.62 
 
 
204 aa  57.4  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  24.19 
 
 
295 aa  55.8  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  31.68 
 
 
199 aa  54.7  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  32.67 
 
 
191 aa  54.7  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  27.08 
 
 
190 aa  53.9  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  30.69 
 
 
194 aa  53.9  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  26.73 
 
 
188 aa  52.8  0.000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  26.8 
 
 
191 aa  50.4  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  27.08 
 
 
191 aa  50.1  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  22.41 
 
 
195 aa  48.9  0.00007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  30.17 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  33.66 
 
 
215 aa  47.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  27.6 
 
 
190 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  26.87 
 
 
201 aa  45.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3101  protein of unknown function DUF1211  25.48 
 
 
190 aa  44.3  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.642215  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  28.8 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  27.52 
 
 
193 aa  42  0.008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>