19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcav_0171 on replicon NC_012669
Organism: Beutenbergia cavernae DSM 12333



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 
214 aa  406  1.0000000000000001e-112  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  37.93 
 
 
201 aa  85.9  4e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  36.5 
 
 
206 aa  64.7  0.000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  40.98 
 
 
206 aa  60.5  0.00000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  40.16 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  36.89 
 
 
210 aa  59.7  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  37.76 
 
 
215 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  36.69 
 
 
218 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  39.25 
 
 
212 aa  53.1  0.000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  28.74 
 
 
220 aa  52.4  0.000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  26.54 
 
 
295 aa  51.2  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  31.75 
 
 
268 aa  50.4  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  31.88 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  33.33 
 
 
195 aa  48.9  0.00006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  28.5 
 
 
190 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  29.91 
 
 
210 aa  45.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  27.52 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  25.77 
 
 
188 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  23.62 
 
 
199 aa  43.1  0.003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>