40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0930 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  100 
 
 
195 aa  391  1e-108  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0746  hypothetical protein  33.17 
 
 
218 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.272843  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  36.81 
 
 
194 aa  106  2e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  33.53 
 
 
205 aa  105  4e-22  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  42.02 
 
 
191 aa  101  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  37.41 
 
 
193 aa  101  9e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  29.23 
 
 
188 aa  98.6  5e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  40.35 
 
 
191 aa  98.2  7e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  36.3 
 
 
203 aa  94.7  7e-19  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  34.78 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  34.78 
 
 
193 aa  94.7  8e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  32.92 
 
 
190 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2628  protein of unknown function DUF1211  41.23 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.422591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1498  hypothetical protein  41.23 
 
 
191 aa  93.2  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.37099  normal  0.468877 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  32.33 
 
 
199 aa  92.8  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  32.21 
 
 
172 aa  92.4  4e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  36.43 
 
 
194 aa  90.9  1e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  35.88 
 
 
199 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  32.3 
 
 
190 aa  82.4  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0561  hypothetical protein  41.67 
 
 
190 aa  80.9  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  31.5 
 
 
205 aa  69.7  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  35.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  32.33 
 
 
200 aa  62  0.000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  25.41 
 
 
215 aa  61.2  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  35.79 
 
 
334 aa  59.7  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  30.1 
 
 
208 aa  56.6  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  34.65 
 
 
268 aa  55.1  0.0000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  29.23 
 
 
295 aa  52.4  0.000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1506  hypothetical protein  30.17 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.248603  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  26.04 
 
 
216 aa  49.3  0.00003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 
214 aa  49.3  0.00003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7900  protein of unknown function DUF1211  31.53 
 
 
215 aa  49.3  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  30.93 
 
 
212 aa  48.5  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  24.56 
 
 
239 aa  48.1  0.00009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  26.74 
 
 
197 aa  47.8  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  24 
 
 
204 aa  46.6  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  27.36 
 
 
219 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3607  hypothetical protein  34.85 
 
 
229 aa  44.7  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.39281  hitchhiker  0.000432475 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  25.49 
 
 
218 aa  44.7  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  28.7 
 
 
220 aa  42.7  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>