16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2044 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  100 
 
 
197 aa  397  9.999999999999999e-111  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  32.67 
 
 
203 aa  53.1  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  31.3 
 
 
202 aa  52  0.000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  33.33 
 
 
194 aa  51.2  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  26.56 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0930  integral membrane protein  26.74 
 
 
195 aa  47.8  0.0001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1494  hypothetical protein  31 
 
 
191 aa  47  0.0002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0095  hypothetical protein  33.33 
 
 
334 aa  45.4  0.0005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.320202  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  31.46 
 
 
205 aa  45.4  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  28.17 
 
 
193 aa  45.1  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  29.59 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  29.59 
 
 
193 aa  44.3  0.001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  26.14 
 
 
212 aa  44.7  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0932  hypothetical protein  29.35 
 
 
188 aa  43.9  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000598079  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  26.23 
 
 
191 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  30 
 
 
194 aa  43.5  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>