31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_3343 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 
219 aa  438  9.999999999999999e-123  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  46.12 
 
 
251 aa  155  4e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  32.2 
 
 
206 aa  85.5  6e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  33.49 
 
 
212 aa  81.3  0.00000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  32.28 
 
 
202 aa  75.1  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  28.8 
 
 
215 aa  72.4  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  25.38 
 
 
210 aa  68.2  0.0000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  31.4 
 
 
268 aa  65.9  0.0000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  28.72 
 
 
218 aa  63.2  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  29.73 
 
 
206 aa  61.6  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  34.95 
 
 
295 aa  60.5  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  27.85 
 
 
211 aa  60.5  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  27.27 
 
 
220 aa  58.9  0.00000006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  23.57 
 
 
193 aa  57.8  0.0000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  29.73 
 
 
204 aa  57  0.0000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  33.33 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  28.86 
 
 
203 aa  55.5  0.0000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  29.41 
 
 
201 aa  54.3  0.000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  28.85 
 
 
210 aa  50.4  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  26.52 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  26.96 
 
 
219 aa  49.7  0.00004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  29 
 
 
205 aa  49.3  0.00005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  29.76 
 
 
194 aa  48.5  0.00007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0171  protein of unknown function DUF1211  27.44 
 
 
214 aa  48.5  0.00008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.802935  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2044  hypothetical protein  24.86 
 
 
197 aa  48.1  0.0001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00130597  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1918  hypothetical protein  24.19 
 
 
199 aa  47.8  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.990062  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  20.65 
 
 
194 aa  47  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  25 
 
 
191 aa  43.9  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0140  hypothetical protein  24.18 
 
 
172 aa  43.1  0.003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2545  protein of unknown function DUF1211  22.78 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2930  hypothetical protein  22.78 
 
 
193 aa  41.6  0.009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>