33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3585 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3585  protein of unknown function DUF1211  100 
 
 		 251 aa  494  1e-139  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.675364  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3343  protein of unknown function DUF1211  46.12 
 
 		 219 aa  157  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000478495  normal  0.0383935 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0449  protein of unknown function DUF1211  35.23 
 
 		 212 aa  84  0.000000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00327642 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0934  hypothetical protein  34.16 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2895  hypothetical protein  31.19 
 
 		 206 aa  78.2  0.0000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00219687  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4399  protein of unknown function DUF1211  30.11 
 
 		 218 aa  74.7  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0114  hypothetical protein  33.71 
 
 		 219 aa  74.7  0.000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4865  protein of unknown function DUF1211  29.8 
 
 		 206 aa  70.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2846  protein of unknown function DUF1211  29 
 
 		 268 aa  67  0.0000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.894119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2754  protein of unknown function DUF1211  30.37 
 
 		 216 aa  56.6  0.0000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.423901 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4230  hypothetical protein  27.17 
 
 		 202 aa  56.6  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3367  hypothetical protein  27.46 
 
 		 239 aa  54.7  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.322545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1196  hypothetical protein  29.91 
 
 		 205 aa  54.7  0.000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.251437  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2037  hypothetical protein  30.33 
 
 		 204 aa  54.3  0.000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1689  hypothetical protein  27.27 
 
 		 210 aa  54.3  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6231  protein of unknown function DUF1211  25.7 
 
 		 208 aa  53.9  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32130  predicted integral membrane protein  28.42 
 
 		 211 aa  53.5  0.000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.716985  normal  0.197382 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2725  protein of unknown function DUF1211  29.53 
 
 		 200 aa  53.1  0.000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.672952 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3436  hypothetical protein  31.71 
 
 		 194 aa  53.1  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0471  hypothetical protein  31.31 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.357569  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4641  hypothetical protein  26.09 
 
 		 210 aa  52.4  0.000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.297492  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2298  protein of unknown function DUF1211  30.88 
 
 		 201 aa  51.2  0.00002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0589  protein of unknown function DUF1211  27.17 
 
 		 190 aa  50.1  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0814  hypothetical protein  25.15 
 
 		 295 aa  48.5  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.478948  normal  0.331036 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0541  hypothetical protein  31.73 
 
 		 205 aa  47  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1482  protein of unknown function DUF1211  28.83 
 
 		 210 aa  46.2  0.0005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2689  protein of unknown function DUF1211  29.23 
 
 		 199 aa  45.8  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.189165  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2908  protein of unknown function DUF1211  24.58 
 
 		 193 aa  45.4  0.0008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00285394  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2934  hypothetical protein  28.28 
 
 		 194 aa  44.7  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000165947  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1696  hypothetical protein  24.65 
 
 		 220 aa  44.3  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.393588 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5128  hypothetical protein  27.07 
 
 		 201 aa  43.9  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0872025 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1340  hypothetical protein  28.57 
 
 		 191 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.217938 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0591  protein of unknown function DUF1211  28.9 
 
 		 190 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.763483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>