More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_4228 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_4228  response regulator receiver protein  100 
 
 		 126 aa  250  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.987828 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2233  LuxR response regulator receiver  47.01 
 
 		 228 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0606  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.69 
 
 		 212 aa  99  2e-20  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 236 aa  97.8  5e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.361751  hitchhiker  0.00000337078 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4479  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 224 aa  95.9  2e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.518456  normal  0.598935 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4744  response regulator receiver protein  43.97 
 
 		 209 aa  95.1  3e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.620464  normal  0.690137 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  34.75 
 
 		 216 aa  94.4  5e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7301  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 220 aa  93.2  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6211  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.377169 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4038  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.4 
 
 		 253 aa  92  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2510  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.02 
 
 		 217 aa  92.4  2e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4871  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 222 aa  91.3  4e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.134443  normal  0.31614 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0975  two component LuxR family transcriptional regulator  37.61 
 
 		 222 aa  91.3  4e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1318  response regulator receiver  41.67 
 
 		 225 aa  91.3  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  44.63 
 
 		 215 aa  90.5  6e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3912  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 230 aa  90.5  6e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0806  two component LuxR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 216 aa  90.5  7e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1142  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 222 aa  90.5  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.661777  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2710  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.38 
 
 		 230 aa  90.5  8e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.248821  normal  0.606697 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4902  response regulator receiver  42.24 
 
 		 216 aa  90.1  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.443208  normal  0.676579 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3696  two component transcriptional regulator, LuxR family  49.52 
 
 		 217 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2717  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 223 aa  89.4  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2629  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 232 aa  90.1  1e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.312922  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4132  response regulator receiver  38.21 
 
 		 235 aa  89.4  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.232221  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2225  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 209 aa  90.1  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2957  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 201 aa  89.7  1e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00144362  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4672  response regulator receiver protein  38.98 
 
 		 212 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.223352  normal  0.339353 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8799  response regulator receiver protein  42.74 
 
 		 227 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.755207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0160  two component LuxR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 212 aa  89  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2842  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.37 
 
 		 226 aa  89  2e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.622781  decreased coverage  0.00305681 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2683  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.59 
 
 		 209 aa  88.6  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4134  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 250 aa  88.2  3e-17  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7009  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 218 aa  88.6  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0896567  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1863  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.88 
 
 		 216 aa  88.6  3e-17  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000548978  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5905  response regulator receiver protein  42.15 
 
 		 227 aa  88.6  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0252894  normal  0.145246 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0759  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.19 
 
 		 221 aa  88.2  3e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.174089  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0799  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.03 
 
 		 226 aa  88.6  3e-17  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0236  LuxR family two component transcriptional regulator  39.84 
 
 		 218 aa  87.8  4e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2804  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.5 
 
 		 216 aa  87.8  4e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.995251  normal  0.311692 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3421  two component LuxR family transcriptional regulator  38.98 
 
 		 223 aa  87.8  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0556432 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3541  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.44 
 
 		 211 aa  87.8  5e-17  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.485125  normal  0.513005 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0262  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 225 aa  87.4  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0721339  normal  0.623073 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0508  response regulator receiver protein  40.68 
 
 		 212 aa  87.4  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7105  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.87 
 
 		 241 aa  87.8  5e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.106023  normal  0.469545 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03540  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  43.22 
 
 		 226 aa  87.4  6e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1040  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 391 aa  87.4  6e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.369353  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4433  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 215 aa  87.4  6e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1616  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.66 
 
 		 226 aa  87.4  6e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0231149  normal  0.0629914 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1071  two component LuxR family transcriptional regulator  41.38 
 
 		 209 aa  87.4  6e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 213 aa  87.4  6e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1815  two component LuxR family transcriptional regulator  41.88 
 
 		 213 aa  87  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.922696  normal  0.34679 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1030  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.32 
 
 		 212 aa  87.4  7e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0775  LuxR family two component transcriptional regulator  38.46 
 
 		 234 aa  87  8e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.336237 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30650  response regulator GacA  38.14 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00700013 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.07 
 
 		 219 aa  87  8e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2613  response regulator GacA  38.14 
 
 		 214 aa  87  8e-17  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.466832  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0655  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 194 aa  87  9e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0346  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.52 
 
 		 210 aa  87  9e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0205277  normal  0.823307 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5050  DNA-binding response regulator  38.52 
 
 		 200 aa  87  9e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  38.46 
 
 		 242 aa  86.3  1e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2233  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.46 
 
 		 232 aa  86.3  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00197033  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1846  LuxR family two component transcriptional regulator  42.5 
 
 		 226 aa  86.7  1e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.699471  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1125  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 229 aa  86.7  1e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.306134 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2445  response regulator receiver protein  44.34 
 
 		 218 aa  86.7  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0115114  normal  0.02149 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5719  two component transcriptional regulator, LuxR family  55.29 
 
 		 232 aa  86.3  1e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0254  LuxR family DNA-binding response regulator  35.38 
 
 		 215 aa  85.5  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1910  response regulator receiver protein  45.28 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.238062  normal  0.36963 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1986  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.32 
 
 		 226 aa  85.9  2e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2486  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 208 aa  85.9  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1600  two component LuxR family transcriptional regulator  38.71 
 
 		 207 aa  85.9  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1981  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 230 aa  85.5  2e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6405  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 225 aa  85.5  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3871  two component LuxR family transcriptional regulator  38.52 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00685623  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 242 aa  86.3  2e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5482  DNA-binding response regulator  37.7 
 
 		 200 aa  85.5  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3251  response regulator receiver protein  37.61 
 
 		 221 aa  85.1  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0793449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1624  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.18 
 
 		 201 aa  85.5  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0305603  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2737  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.83 
 
 		 227 aa  85.1  3e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.418014  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7589  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 225 aa  85.1  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.438424  normal  0.37363 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3643  two component LuxR family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 215 aa  85.1  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.516516  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003136  transcriptional regulator LuxR family protein  30.77 
 
 		 212 aa  85.1  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.12843  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5531  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5200  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5597  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 200 aa  84.7  4e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0938  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 242 aa  84.7  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3249  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 211 aa  84.7  4e-16  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.414819  normal  0.558116 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.17 
 
 		 241 aa  84.3  5e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0625  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.14 
 
 		 216 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.732521  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  32.2 
 
 		 208 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5475  DNA-binding response regulator  36.89 
 
 		 200 aa  84.3  5e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.132453  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0258  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.68 
 
 		 200 aa  84.3  5e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.59 
 
 		 232 aa  84.3  6e-16  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3768  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.46 
 
 		 223 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.28303  normal  0.763501 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3676  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.88 
 
 		 214 aa  84  6e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0625047  normal  0.0780809 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5628  two component transcriptional regulator, LuxR family  43.22 
 
 		 200 aa  84  6e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.946433  normal  0.876589 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5150  two component LuxR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 200 aa  84.3  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 228 aa  84  7e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.63 
 
 		 229 aa  84  7e-16  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1417  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 234 aa  84  7e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0224272 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0983  two component LuxR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 213 aa  84  7e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>