More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2736 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2736  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  100 
 
 		 442 aa  906    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  75.11 
 
 		 442 aa  684    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2565  histidine kinase  75.11 
 
 		 442 aa  679    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  63.84 
 
 		 462 aa  582  1.0000000000000001e-165  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.894513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2814  sensor histidine kinase  64.99 
 
 		 443 aa  567  1e-160  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  60.54 
 
 		 445 aa  549  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  60.6 
 
 		 445 aa  543  1e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238926  normal  0.0632416 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  52.18 
 
 		 445 aa  423  1e-117  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.124248  normal  0.045206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  37.45 
 
 		 863 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.88 
 
 		 919 aa  150  5e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.4 
 
 		 480 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 449 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.89 
 
 		 630 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 557 aa  143  5e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  34.66 
 
 		 548 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.64 
 
 		 1021 aa  138  2e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  32.89 
 
 		 1850 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 408 aa  137  4e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 448 aa  137  4e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.63 
 
 		 654 aa  137  4e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3466  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.94 
 
 		 548 aa  136  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0535402  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.62 
 
 		 683 aa  136  9e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.93 
 
 		 458 aa  136  9e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3383  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.17 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.918408  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.62 
 
 		 1465 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 		 614 aa  133  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.1 
 
 		 392 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0091  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.58 
 
 		 486 aa  133  6e-30  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  33.59 
 
 		 577 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 577 aa  133  7.999999999999999e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  33.1 
 
 		 457 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  32.64 
 
 		 305 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.61 
 
 		 1062 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.72 
 
 		 571 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  30.37 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  35.71 
 
 		 524 aa  131  3e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  31.58 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  33.19 
 
 		 1061 aa  130  5.0000000000000004e-29  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1855  histidine kinase  34.86 
 
 		 600 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.355606  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4189  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 699 aa  129  8.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.4 
 
 		 609 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1728  histidine kinase  32.75 
 
 		 560 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.864697  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  32.34 
 
 		 566 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 		 1123 aa  129  9.000000000000001e-29  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  32.76 
 
 		 429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0276  sensor histidine kinase  35.61 
 
 		 659 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1043  histidine kinase  37.21 
 
 		 585 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1802  histidine kinase  32.75 
 
 		 540 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.963501  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2809  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.74 
 
 		 690 aa  128  2.0000000000000002e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.8 
 
 		 1146 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1549  histidine kinase  32.66 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.924403  normal  0.563022 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.85 
 
 		 763 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1831  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.21 
 
 		 685 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.74 
 
 		 686 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1428  histidine kinase  30.98 
 
 		 457 aa  128  2.0000000000000002e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2952  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 		 598 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.078149 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.77 
 
 		 850 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.346291  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.12 
 
 		 981 aa  127  3e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.000864337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4833  sensory box histidine kinase  35.29 
 
 		 899 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3994  sensor histidine kinase  36.43 
 
 		 585 aa  127  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0892776 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.09 
 
 		 771 aa  127  3e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.79 
 
 		 455 aa  127  3e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.18 
 
 		 850 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0331  C4-dicarboxylate transport sensor kinase transcription regulator protein  37.04 
 
 		 665 aa  127  4.0000000000000003e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2667  histidine kinase  33.7 
 
 		 486 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  31.78 
 
 		 505 aa  127  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.57 
 
 		 633 aa  127  5e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1088  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.72 
 
 		 822 aa  127  5e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.436726 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  32.86 
 
 		 308 aa  127  5e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1893  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.62 
 
 		 985 aa  127  5e-28  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.426931  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2491  histidine kinase  35.43 
 
 		 626 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00653758 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  29.38 
 
 		 485 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.82 
 
 		 833 aa  127  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  32.75 
 
 		 451 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 457 aa  127  6e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  33.33 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  32.62 
 
 		 626 aa  126  7e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 373 aa  126  7e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5807  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 		 990 aa  126  8.000000000000001e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2543  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.73 
 
 		 823 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.906632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4373  PAS  34.5 
 
 		 907 aa  125  1e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.323082  normal  0.21328 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.5 
 
 		 450 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 467 aa  125  1e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1327  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 		 375 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3756  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.73 
 
 		 452 aa  125  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  29.9 
 
 		 708 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1988  sensor protein for response regulator AtoC  28.03 
 
 		 715 aa  125  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.431904  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.32 
 
 		 681 aa  125  2e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2691  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0922  EAL/GGDEF domain-containing protein  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.74 
 
 		 862 aa  124  2e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 557 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2386  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2532  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 		 375 aa  125  2e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  30.25 
 
 		 601 aa  125  2e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2467  sensor histidine kinase  31.91 
 
 		 627 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333423  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>