More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_3756 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_1172  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  74.72 
 
 		 450 aa  658    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3756  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 452 aa  898    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  75.11 
 
 		 451 aa  647    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  60.67 
 
 		 455 aa  532  1e-150  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0344  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  51.05 
 
 		 459 aa  393  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.337335  normal  0.899671 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  46.39 
 
 		 449 aa  371  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3946  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.99 
 
 		 448 aa  362  5.0000000000000005e-99  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2495  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.43 
 
 		 463 aa  360  3e-98  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0489906  normal  0.418154 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1145  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.8 
 
 		 457 aa  360  4e-98  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.44 
 
 		 458 aa  357  2.9999999999999997e-97  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.03 
 
 		 480 aa  353  2.9999999999999997e-96  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  45.28 
 
 		 470 aa  350  3e-95  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3093  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  44.55 
 
 		 444 aa  322  8e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0491  hydrogen uptake histidine-kinase  43.22 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2142  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  43.22 
 
 		 443 aa  308  9e-83  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.479611  normal  0.191224 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3380  hypothetical protein  42.79 
 
 		 439 aa  296  5e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.98 
 
 		 1465 aa  194  2e-48  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2409  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.17 
 
 		 713 aa  191  2e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00581493 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.02 
 
 		 1021 aa  188  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.5 
 
 		 1146 aa  187  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5447  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  40.07 
 
 		 448 aa  184  2.0000000000000003e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.151261 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 		 467 aa  182  2e-44  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.54 
 
 		 683 aa  181  2e-44  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  36.36 
 
 		 439 aa  175  9.999999999999999e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1954  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.424678 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1316  Diverse 7TM receptor transmembrane region  36.24 
 
 		 708 aa  170  6e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 594 aa  169  7e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2365  histidine kinase  36.47 
 
 		 435 aa  169  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2742  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.19 
 
 		 467 aa  168  2e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.759384  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2543  sensor histidine kinase  37.07 
 
 		 460 aa  167  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  33.45 
 
 		 730 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4489  serine/threonine protein kinase and signal transduction histidine kinase with GAF sensor  34.59 
 
 		 1850 aa  166  6.9999999999999995e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.613962  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2945  sensor histidine kinase/response regulator  36.49 
 
 		 505 aa  166  8e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.16803 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2796  phosphoglycerate transport; protein for signal transmission  33.92 
 
 		 724 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00000463972  normal  0.015669 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 678 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.79 
 
 		 392 aa  164  4.0000000000000004e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1567  histidine kinase  32.45 
 
 		 310 aa  162  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5455  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.3 
 
 		 571 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0104043  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2466  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  33.23 
 
 		 688 aa  161  2e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0733  sensory box sensor histidine kinase  37.54 
 
 		 358 aa  162  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.724389  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0203  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.24 
 
 		 439 aa  161  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.283805 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1575  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.96 
 
 		 683 aa  160  4e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.539969  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2312  Signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 389 aa  160  6e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2287  histidine kinase  34.77 
 
 		 770 aa  159  7e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.709847  normal  0.24871 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1210  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 1036 aa  159  8e-38  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1533  histidine kinase  35.13 
 
 		 497 aa  159  8e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0413  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 		 715 aa  159  1e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.0426655 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3803  histone-like DNA-binding protein  34.98 
 
 		 308 aa  159  1e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 494 aa  158  2e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4401  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  37.04 
 
 		 641 aa  158  2e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000108821  hitchhiker  0.00000304156 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2545  sensor histidine kinase  34.04 
 
 		 429 aa  157  3e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0601  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  37.73 
 
 		 1187 aa  157  3e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0521  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  34.34 
 
 		 1072 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4885  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  36.6 
 
 		 971 aa  157  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00047345  hitchhiker  0.00891826 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1925  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.574394  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2229  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1718  sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 389 aa  157  3e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1660  sensory box sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0709  sensory box sensor histidine kinase  36.75 
 
 		 358 aa  157  4e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.09 
 
 		 553 aa  157  4e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2391  Diverse 7TM receptor transmembrane region  33.79 
 
 		 726 aa  156  6e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  30.95 
 
 		 601 aa  156  6e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2296  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.64 
 
 		 679 aa  156  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  33.1 
 
 		 566 aa  156  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  36 
 
 		 305 aa  155  1e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4716  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.68 
 
 		 1808 aa  155  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.230197  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01455  sensor histidine kinase  32.97 
 
 		 436 aa  155  1e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.41 
 
 		 571 aa  155  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4155  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.68 
 
 		 440 aa  155  2e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.50715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3827  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.3 
 
 		 585 aa  154  4e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.474444  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  35.74 
 
 		 557 aa  153  7e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3976  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  33.56 
 
 		 431 aa  152  1e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0119459  decreased coverage  0.00202838 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.13 
 
 		 577 aa  152  1e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1980  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  36.42 
 
 		 1901 aa  152  2e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0349147  normal  0.535824 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2093  histidine kinase  35.09 
 
 		 468 aa  151  2e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.578999  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  37.13 
 
 		 577 aa  152  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0246  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 573 aa  150  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0266042 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6440  histidine kinase  36.65 
 
 		 611 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.920923  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1253  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.46 
 
 		 673 aa  151  3e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0203  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 928 aa  150  3e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5029  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.56 
 
 		 537 aa  150  5e-35  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.559504  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02433  sensor histide kinase  33.09 
 
 		 482 aa  150  6e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1669  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.23 
 
 		 675 aa  150  6e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.532604  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3259  sensor histidine kinase  32.49 
 
 		 598 aa  149  7e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408532  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0076  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.53 
 
 		 675 aa  149  7e-35  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4049  histidine kinase  36.82 
 
 		 630 aa  149  8e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.431231  normal  0.418791 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  34.46 
 
 		 681 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3474  histidine kinase  36.8 
 
 		 449 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  33.09 
 
 		 524 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  35.23 
 
 		 470 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5938  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5574  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.26 
 
 		 611 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2556  ATP-binding region, ATPase-like  33.9 
 
 		 1811 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0083  Serine/threonine protein kinase and Signal transduction histidine kinase (STHK) with GAF sensor  33.22 
 
 		 1780 aa  146  8.000000000000001e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.000111107  normal  0.0603915 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3608  sensor histidine kinase  33.7 
 
 		 313 aa  145  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0632  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 		 695 aa  145  1e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.554525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 633 aa  145  1e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2188  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.16 
 
 		 572 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.363862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_26810  putative two-component sensor  34.31 
 
 		 371 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>