More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_2951 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A2814  sensor histidine kinase  89.84 
 
 
443 aa  790    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2951  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
462 aa  943    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.894513  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1288  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  65.75 
 
 
445 aa  595  1e-169  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.238926  normal  0.0632416 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2692  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  65.3 
 
 
445 aa  591  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2736  transmembrane sensor histidine kinase transcription regulator protein  63.84 
 
 
442 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2975  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  62.24 
 
 
442 aa  568  1e-161  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2565  histidine kinase  61.78 
 
 
442 aa  562  1.0000000000000001e-159  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3727  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  49.07 
 
 
445 aa  399  9.999999999999999e-111  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.124248  normal  0.045206 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3061  ATP-binding region ATPase domain protein  35.63 
 
 
863 aa  168  2e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.141845  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2389  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 
919 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0121364  normal  0.244998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2797  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 
480 aa  147  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0071  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 
392 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2719  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 
683 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0765  histidine kinase  29.03 
 
 
601 aa  137  4e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2013  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
455 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0971  PAS  32.03 
 
 
1187 aa  136  8e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.875405  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3478  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.86 
 
 
1021 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1953  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.15 
 
 
458 aa  134  5e-30  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  37.93 
 
 
630 aa  133  5e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.449456  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5024  histidine kinase  34.28 
 
 
457 aa  133  6e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2449  putative two-component sensor  32.63 
 
 
305 aa  133  9e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1291  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  38.26 
 
 
690 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3017  sensor histidine kinase  32.98 
 
 
524 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.413812  normal  0.591209 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0603  sensory box sensor histidine kinase  30.51 
 
 
439 aa  132  2.0000000000000002e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1978  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
553 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.260474  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4122  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.29 
 
 
449 aa  131  2.0000000000000002e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0672  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  36.67 
 
 
373 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4305  periplasmic sensor Signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
594 aa  130  4.0000000000000003e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.350102  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1567  histidine kinase  35.27 
 
 
567 aa  130  4.0000000000000003e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0672  histidine kinase  36.67 
 
 
373 aa  130  6e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0658  sensor histide kinase  29.9 
 
 
315 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2716  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.01 
 
 
592 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3477  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
1465 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3228  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 
609 aa  129  9.000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1524  histidine kinase  34.01 
 
 
592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.64718e-19 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01018  histidine kinase  32.63 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.185766  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06148  histidine kinase  32.63 
 
 
408 aa  129  1.0000000000000001e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00011043  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2028  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.8 
 
 
1247 aa  129  1.0000000000000001e-28  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.138072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3067  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
577 aa  128  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.405289  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2249  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  34.06 
 
 
771 aa  128  2.0000000000000002e-28  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2841  ATPase domain-containing protein  32.68 
 
 
577 aa  129  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.274853  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2148  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.97 
 
 
819 aa  127  3e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.233006  hitchhiker  0.00949178 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0638  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  36.47 
 
 
373 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4217  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.25 
 
 
686 aa  127  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34172  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3516  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.73 
 
 
614 aa  127  5e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.166046 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_134  sensor histidine kinase  33.2 
 
 
1062 aa  127  5e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2038  histidine kinase  34.25 
 
 
552 aa  127  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1526  ATP-binding region ATPase domain protein  30.14 
 
 
730 aa  127  5e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.559372  normal  0.545024 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0617  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 
557 aa  127  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.543989  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2369  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.91 
 
 
1146 aa  126  7e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2959  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
571 aa  126  1e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2832  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.64 
 
 
745 aa  125  1e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.34987  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2584  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  37.02 
 
 
654 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0675  two-component sensor kinase CbrA  34.4 
 
 
975 aa  125  1e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0127  sensory box sensor histidine kinase  33.76 
 
 
1061 aa  124  2e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2272  putative two-component sensor  30.21 
 
 
433 aa  124  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3575  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 
494 aa  125  2e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.242306  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5143  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.38 
 
 
408 aa  124  3e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.19932  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3581  histidine kinase  31.58 
 
 
739 aa  124  3e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.1112  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3720  histidine kinase  35.14 
 
 
693 aa  124  3e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3068  histidine kinase  28.26 
 
 
485 aa  124  3e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.158411  normal  0.556433 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0886  GAF sensor hybrid histidine kinase  34.75 
 
 
842 aa  124  4e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435524 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1953  histidine kinase  32.63 
 
 
661 aa  124  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0316  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  35.91 
 
 
764 aa  124  4e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.889284 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2108  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.48 
 
 
1123 aa  124  4e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0625  sensory box sensor histidine kinase  32.91 
 
 
853 aa  124  5e-27  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0137493  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3392  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.4 
 
 
662 aa  124  5e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000136214  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.01 
 
 
567 aa  124  5e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5981  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.1 
 
 
602 aa  123  6e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3756  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
452 aa  123  6e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0558  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.85 
 
 
763 aa  123  7e-27  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.043921  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0614  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
626 aa  123  7e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.294788  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2200  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.1 
 
 
848 aa  123  7e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00863508  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03495  Signal transduction histidine kinase  30.93 
 
 
557 aa  123  9e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1676  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.18 
 
 
850 aa  122  9e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.109527  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0835  histidine kinase  33.97 
 
 
418 aa  123  9e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.882013  normal  0.0872609 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3026  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.85 
 
 
819 aa  122  9.999999999999999e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.956622  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4555  response regulator receiver Signal transduction histidine kinase  29.87 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3530  histidine kinase  30.55 
 
 
548 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3646  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 
522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00328327  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0965  PAS:hemerythrin HHE cation binding region  35.77 
 
 
681 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.94683  normal  0.555707 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1037  histidine kinase  30.48 
 
 
608 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2270  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
661 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2324  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.58 
 
 
1089 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3080  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.76 
 
 
633 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00766415 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1180  ATP-binding region, ATPase-like  31.85 
 
 
451 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.513704  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1221  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
862 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000508764  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6277  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.88 
 
 
594 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0231  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
844 aa  122  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.794534  normal  0.63544 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4457  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.4 
 
 
661 aa  121  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2830  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  32.45 
 
 
631 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3002  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.14 
 
 
1234 aa  121  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.131007 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1535  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  29.97 
 
 
566 aa  121  3e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2652  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  33.45 
 
 
833 aa  121  3e-26  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0260  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
627 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1123  sensor histidine kinase  29.17 
 
 
471 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2159  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
498 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0755  sensor histidine kinase  30.42 
 
 
627 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.997175  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_30840  putative signal transduction histidine kinase  32.16 
 
 
470 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000329503  hitchhiker  1.67285e-16 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0788  sensor histidine kinase  29.17 
 
 
465 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.105833  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>