More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1134 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  71.14 
 
 		 441 aa  664    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  71.92 
 
 		 441 aa  671    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  70.45 
 
 		 440 aa  663    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  72.15 
 
 		 441 aa  674    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  71.07 
 
 		 438 aa  660    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  71.36 
 
 		 441 aa  668    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  72.05 
 
 		 441 aa  675    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  70.25 
 
 		 454 aa  661    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  100 
 
 		 441 aa  917    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  70.48 
 
 		 454 aa  629  1e-179  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  63.72 
 
 		 442 aa  595  1e-169  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  63.41 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  63.41 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  63.41 
 
 		 443 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  63.97 
 
 		 434 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  50.12 
 
 		 439 aa  459  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  47.22 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  48.48 
 
 		 466 aa  407  1.0000000000000001e-112  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  50.64 
 
 		 399 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  46.53 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  44.88 
 
 		 471 aa  377  1e-103  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  43.68 
 
 		 460 aa  355  5.999999999999999e-97  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.6 
 
 		 375 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  29.37 
 
 		 389 aa  130  4.0000000000000003e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  28.71 
 
 		 427 aa  126  9e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.35 
 
 		 397 aa  125  1e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  28.03 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  29.59 
 
 		 429 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.89 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.89 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.47 
 
 		 428 aa  120  3.9999999999999996e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.2 
 
 		 409 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  29.3 
 
 		 438 aa  120  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  29.69 
 
 		 427 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.27 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2628  citrate synthase  28.89 
 
 		 387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0124  citrate synthase I  28.37 
 
 		 416 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.559249  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  29.49 
 
 		 412 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  30.1 
 
 		 425 aa  117  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.79 
 
 		 385 aa  117  3.9999999999999997e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  27.34 
 
 		 430 aa  116  6e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  29.41 
 
 		 428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  30.23 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  28.6 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  29.78 
 
 		 427 aa  114  3e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  28.72 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  29.68 
 
 		 428 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  28.78 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  28.45 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  28.78 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  28.78 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0612  citrate synthase  27.09 
 
 		 386 aa  114  5e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.148892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  28.3 
 
 		 454 aa  113  5e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  29.68 
 
 		 428 aa  113  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2214  citrate synthase I  29.32 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.525644  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  29.68 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2819  type II citrate synthase  29.55 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0484944  normal  0.528181 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  29.68 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  28.95 
 
 		 430 aa  113  8.000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  26.61 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  28.98 
 
 		 432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0279  citrate synthase  27.78 
 
 		 396 aa  112  1.0000000000000001e-23  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  28.35 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  28.75 
 
 		 428 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  28.86 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.81 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  29.68 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  27.81 
 
 		 426 aa  111  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  26.4 
 
 		 370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  27.09 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1151  citrate synthase  27.03 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00353381  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  27.42 
 
 		 425 aa  110  3e-23  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0075  citrate synthase  29.38 
 
 		 416 aa  111  3e-23  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  28.65 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  29.22 
 
 		 428 aa  110  3e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  26.25 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1370  citrate synthase  28.57 
 
 		 423 aa  110  4.0000000000000004e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  29.89 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  29.89 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  29.89 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  29.89 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  27.51 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2413  citrate synthase  28.12 
 
 		 397 aa  110  6e-23  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  27.51 
 
 		 429 aa  110  6e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  27.09 
 
 		 428 aa  110  6e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  27.51 
 
 		 429 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3036  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.25 
 
 		 382 aa  110  7.000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  29.38 
 
 		 437 aa  110  7.000000000000001e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  29.91 
 
 		 431 aa  110  7.000000000000001e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  28.74 
 
 		 436 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  28.61 
 
 		 428 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3065  citrate synthase  26.38 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  27.06 
 
 		 429 aa  109  8.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2672  citrate synthase  26.38 
 
 		 386 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.530506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  26.84 
 
 		 429 aa  109  9.000000000000001e-23  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1366  citrate synthase  28.32 
 
 		 423 aa  109  9.000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 434 aa  109  1e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  28.94 
 
 		 433 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  27.38 
 
 		 438 aa  108  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1496  2-methylcitrate synthase  25.07 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>