More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_2689 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  95.69 
 
 		 441 aa  885    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  69.16 
 
 		 443 aa  639    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  81.69 
 
 		 454 aa  752    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  68.71 
 
 		 442 aa  634    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  92.52 
 
 		 441 aa  853    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  84.97 
 
 		 438 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  100 
 
 		 441 aa  919    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  69.16 
 
 		 443 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  82.38 
 
 		 454 aa  719    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  87.95 
 
 		 440 aa  814    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  85.42 
 
 		 441 aa  783    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  69.16 
 
 		 443 aa  639    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  84.97 
 
 		 441 aa  779    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  71.36 
 
 		 441 aa  668    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  63.19 
 
 		 434 aa  568  1e-161  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  52.98 
 
 		 466 aa  442  1e-123  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  50.68 
 
 		 474 aa  438  1e-121  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  54.52 
 
 		 399 aa  436  1e-121  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  49.77 
 
 		 439 aa  432  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  49.32 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  49.42 
 
 		 471 aa  406  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  45.87 
 
 		 460 aa  365  1e-100  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.76 
 
 		 387 aa  130  4.0000000000000003e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  29.95 
 
 		 375 aa  127  3e-28  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  31.06 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  31.06 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  30.73 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  29.16 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  30.3 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  29.73 
 
 		 425 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  30.69 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  30.69 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  30.69 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  30.69 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  31.5 
 
 		 440 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  29.7 
 
 		 437 aa  119  7.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  30.08 
 
 		 436 aa  119  9e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29.5 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  29.71 
 
 		 437 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  29.8 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  28.74 
 
 		 427 aa  118  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  30.12 
 
 		 434 aa  117  3e-25  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  29.92 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  25.48 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  30.08 
 
 		 428 aa  118  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  29.92 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  29.37 
 
 		 432 aa  117  5e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  29.92 
 
 		 433 aa  117  5e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  29 
 
 		 437 aa  116  6e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.58 
 
 		 409 aa  117  6e-25  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  29.35 
 
 		 429 aa  116  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  29.05 
 
 		 436 aa  116  6.9999999999999995e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  29.22 
 
 		 428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  28.64 
 
 		 430 aa  116  7.999999999999999e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  30.17 
 
 		 427 aa  116  8.999999999999998e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.5 
 
 		 428 aa  116  8.999999999999998e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  29.22 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  29.22 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  29.47 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  29.22 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  30.39 
 
 		 454 aa  116  1.0000000000000001e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.95 
 
 		 397 aa  115  1.0000000000000001e-24  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.86 
 
 		 437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  28.29 
 
 		 432 aa  115  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1221  type II citrate synthase  29.46 
 
 		 427 aa  115  1.0000000000000001e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.233861  normal  0.0870629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  30.2 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  30.2 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  30.2 
 
 		 434 aa  114  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  31.9 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  29.1 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  31.9 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  29.29 
 
 		 433 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1783  type II citrate synthase  31.7 
 
 		 429 aa  114  3e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0004224  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  31.9 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  31.9 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  32.56 
 
 		 428 aa  114  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00680  citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2916  citrate synthase I  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.349648  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00669  hypothetical protein  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2935  type II citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.115815  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0732  type II citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.482725  normal  0.945982 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0768  type II citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0638  type II citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  29.07 
 
 		 436 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  29.21 
 
 		 434 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  27.99 
 
 		 389 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0747  type II citrate synthase  30.48 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  28.01 
 
 		 427 aa  113  5e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  28.86 
 
 		 429 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  29.97 
 
 		 428 aa  114  5e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>