More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1124 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  81.46 
 
 
441 aa  745    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  86.56 
 
 
441 aa  800    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  84.97 
 
 
440 aa  790    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  100 
 
 
438 aa  915    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  84.97 
 
 
441 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  80.32 
 
 
454 aa  693    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  71.17 
 
 
443 aa  655    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  87.24 
 
 
441 aa  810    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  71.17 
 
 
443 aa  654    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  70.71 
 
 
442 aa  649    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  71.17 
 
 
443 aa  655    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  79.86 
 
 
454 aa  729    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  71.07 
 
 
441 aa  660    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  81.46 
 
 
441 aa  748    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  65.43 
 
 
434 aa  600  1e-170  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  53.76 
 
 
466 aa  453  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  49.77 
 
 
439 aa  445  1.0000000000000001e-124  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  55.1 
 
 
399 aa  444  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  50.59 
 
 
474 aa  431  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  48.15 
 
 
464 aa  423  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  49.18 
 
 
471 aa  413  1e-114  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  46.17 
 
 
460 aa  371  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  28.4 
 
 
427 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  30.05 
 
 
454 aa  124  3e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.47 
 
 
409 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  27.3 
 
 
427 aa  124  4e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  27.03 
 
 
425 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  30.26 
 
 
433 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  30.26 
 
 
433 aa  123  6e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  30.26 
 
 
433 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  30.26 
 
 
433 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  29.7 
 
 
433 aa  123  7e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  27.25 
 
 
429 aa  122  9e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  28.89 
 
 
434 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  27.39 
 
 
428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  29 
 
 
427 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  27.27 
 
 
375 aa  121  3e-26  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  26.46 
 
 
389 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  28.26 
 
 
434 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  28.72 
 
 
412 aa  120  3.9999999999999996e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.61 
 
 
385 aa  120  3.9999999999999996e-26  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  28.04 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  28.04 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  28.04 
 
 
434 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.05 
 
 
397 aa  119  7.999999999999999e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.02 
 
 
386 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.02 
 
 
386 aa  119  9e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  29.31 
 
 
433 aa  119  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  28.95 
 
 
440 aa  119  9.999999999999999e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  29.31 
 
 
433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  29.2 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1422  type II citrate synthase  30.05 
 
 
428 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.0000689188  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  29.92 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  29.53 
 
 
432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  29.95 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.57 
 
 
387 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  29.92 
 
 
433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  26.78 
 
 
429 aa  118  3e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.55 
 
 
378 aa  117  3e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  29.22 
 
 
430 aa  118  3e-25  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.4 
 
 
437 aa  117  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  29.1 
 
 
428 aa  117  3e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  28.96 
 
 
433 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  27.85 
 
 
426 aa  118  3e-25  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29 
 
 
437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.29 
 
 
409 aa  117  5e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  29.95 
 
 
432 aa  117  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2274  type II citrate synthase  30.72 
 
 
428 aa  116  6e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000358341  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  29.16 
 
 
436 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2348  type II citrate synthase  29.55 
 
 
428 aa  116  6e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.729565  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1650  type II citrate synthase  31.61 
 
 
428 aa  116  6.9999999999999995e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000481967  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  28.61 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  27.3 
 
 
427 aa  116  6.9999999999999995e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2633  type II citrate synthase  30.72 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000579193  normal  0.265493 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1831  type II citrate synthase  30.72 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00000179965  normal  0.249033 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2513  type II citrate synthase  30.72 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000256312  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2520  type II citrate synthase  30.72 
 
 
428 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0560239  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  29.31 
 
 
433 aa  116  8.999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  28.57 
 
 
428 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1926  type II citrate synthase  30.43 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  24.64 
 
 
446 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  27.85 
 
 
463 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  28.82 
 
 
437 aa  115  1.0000000000000001e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  28.18 
 
 
433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  27.36 
 
 
438 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1705  type II citrate synthase  30.43 
 
 
428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00232802  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  28.57 
 
 
425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2508  type II citrate synthase  28.54 
 
 
436 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.636436  normal  0.21976 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  26.76 
 
 
375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1832  type II citrate synthase  30.64 
 
 
430 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0111193  normal  0.0527351 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  30 
 
 
432 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1630  type II citrate synthase  30.43 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.01465  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.14 
 
 
382 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1705  type II citrate synthase  30.43 
 
 
428 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0861056  normal  0.668035 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>