More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3905 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  85.13 
 
 		 441 aa  785    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  83.07 
 
 		 441 aa  763    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  81.51 
 
 		 440 aa  751    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  97.36 
 
 		 454 aa  921    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  80.32 
 
 		 438 aa  731    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  82.38 
 
 		 441 aa  755    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  70.14 
 
 		 443 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  90.93 
 
 		 441 aa  841    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  70.14 
 
 		 443 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  70.14 
 
 		 443 aa  649    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  90.93 
 
 		 441 aa  843    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  70.45 
 
 		 442 aa  648    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  70.48 
 
 		 441 aa  658    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  100 
 
 		 454 aa  944    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  63.68 
 
 		 434 aa  585  1e-166  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  55.87 
 
 		 399 aa  440  9.999999999999999e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  48.74 
 
 		 439 aa  439  9.999999999999999e-123  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  51.64 
 
 		 466 aa  435  1e-121  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  49.65 
 
 		 474 aa  425  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  49.07 
 
 		 471 aa  410  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  47.44 
 
 		 464 aa  401  9.999999999999999e-111  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  46.28 
 
 		 460 aa  376  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  28.42 
 
 		 375 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  29.55 
 
 		 454 aa  132  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  28.81 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.03 
 
 		 428 aa  129  1.0000000000000001e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.26 
 
 		 397 aa  128  2.0000000000000002e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  29.72 
 
 		 436 aa  128  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  29.65 
 
 		 437 aa  127  3e-28  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  29 
 
 		 391 aa  126  7e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.75 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  27.59 
 
 		 429 aa  125  2e-27  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  31.43 
 
 		 433 aa  125  2e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.75 
 
 		 386 aa  125  2e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.21 
 
 		 378 aa  124  3e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  30.2 
 
 		 437 aa  124  3e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  30 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  30.6 
 
 		 440 aa  124  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  29.44 
 
 		 433 aa  124  4e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  30.56 
 
 		 431 aa  124  5e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  26.77 
 
 		 389 aa  123  7e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  30 
 
 		 432 aa  123  7e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29.88 
 
 		 437 aa  123  8e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.87 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  29.04 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  29.82 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  29.16 
 
 		 437 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  27.84 
 
 		 432 aa  121  1.9999999999999998e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  29.82 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  29.82 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  29.82 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  29.78 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  29.7 
 
 		 432 aa  121  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  30.05 
 
 		 438 aa  121  3e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  29.02 
 
 		 436 aa  121  3e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  28.44 
 
 		 450 aa  120  6e-26  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  28.81 
 
 		 433 aa  120  7e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.08 
 
 		 370 aa  119  9e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  29.27 
 
 		 433 aa  119  9e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  29.47 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  29.54 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  29.72 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  29.47 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0083  citrate synthase  28.97 
 
 		 455 aa  119  9.999999999999999e-26  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.33 
 
 		 409 aa  119  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  29.6 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  29.47 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  29.62 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  29.6 
 
 		 433 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  28.24 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  29.51 
 
 		 425 aa  118  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2199  type II citrate synthase  29.08 
 
 		 436 aa  119  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.308068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  29.15 
 
 		 425 aa  118  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  29.04 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  29.87 
 
 		 436 aa  117  3.9999999999999997e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1088  citrate synthase I  28.97 
 
 		 443 aa  117  3.9999999999999997e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.864155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  27.29 
 
 		 427 aa  117  3.9999999999999997e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 		 387 aa  117  3.9999999999999997e-25  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  27.4 
 
 		 427 aa  117  5e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1580  citrate synthase  27.67 
 
 		 383 aa  117  5e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.172478 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  28.94 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  29.18 
 
 		 429 aa  116  6e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2713  citrate synthase  26.6 
 
 		 378 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.656469 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  29.43 
 
 		 429 aa  117  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7227  citrate synthase I  29.26 
 
 		 455 aa  117  6e-25  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.1 
 
 		 437 aa  116  6.9999999999999995e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  28.71 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1400  citrate synthase I  28.97 
 
 		 444 aa  116  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.562441  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  28.71 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  28.71 
 
 		 434 aa  116  7.999999999999999e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>