More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1379 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  88.86 
 
 		 441 aa  827    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  91.82 
 
 		 441 aa  850    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  84.97 
 
 		 438 aa  790    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  87.95 
 
 		 441 aa  814    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  80.82 
 
 		 454 aa  746    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  81.51 
 
 		 454 aa  715    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  82.88 
 
 		 441 aa  764    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  100 
 
 		 440 aa  920    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  82.42 
 
 		 441 aa  761    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  70.45 
 
 		 441 aa  663    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  68.11 
 
 		 443 aa  621  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  68.34 
 
 		 443 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  68.34 
 
 		 443 aa  622  1e-177  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  67.2 
 
 		 442 aa  611  9.999999999999999e-175  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  64.35 
 
 		 434 aa  580  1e-164  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  52.52 
 
 		 466 aa  448  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  54.82 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  50.11 
 
 		 474 aa  440  9.999999999999999e-123  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  49.54 
 
 		 439 aa  436  1e-121  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  47.39 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  49.18 
 
 		 471 aa  405  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  44.85 
 
 		 460 aa  374  1e-102  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  30.13 
 
 		 375 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  31.19 
 
 		 409 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  31.48 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  31.48 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  28.88 
 
 		 427 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  31.48 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  31.48 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.53 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  26.01 
 
 		 446 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  30.71 
 
 		 437 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  30.71 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  30.71 
 
 		 433 aa  124  5e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.11 
 
 		 378 aa  123  5e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  29.76 
 
 		 438 aa  123  6e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  28.47 
 
 		 427 aa  123  7e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  31.28 
 
 		 433 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  30.62 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  28.87 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  30.62 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  30.75 
 
 		 433 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  30.34 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.02 
 
 		 397 aa  122  1.9999999999999998e-26  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  28.3 
 
 		 434 aa  121  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.06 
 
 		 428 aa  121  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  26.65 
 
 		 389 aa  121  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  29.87 
 
 		 433 aa  120  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29.63 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  29.82 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  30.1 
 
 		 427 aa  120  4.9999999999999996e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  30.21 
 
 		 433 aa  120  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  28.07 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0563  citrate synthase  29.11 
 
 		 412 aa  119  7.999999999999999e-26  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  27.82 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  29.72 
 
 		 427 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.93 
 
 		 377 aa  119  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  28.25 
 
 		 436 aa  119  9.999999999999999e-26  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  28.33 
 
 		 454 aa  118  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1692  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.86 
 
 		 409 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.141022  normal  0.100865 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  27.25 
 
 		 431 aa  118  3e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  28.34 
 
 		 438 aa  117  3e-25  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  29.22 
 
 		 427 aa  117  3e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  28.86 
 
 		 429 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  29.65 
 
 		 431 aa  117  5e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  28.35 
 
 		 436 aa  117  5e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  28.35 
 
 		 436 aa  116  6e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  26.74 
 
 		 385 aa  116  6.9999999999999995e-25  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  27.25 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  28.61 
 
 		 429 aa  116  7.999999999999999e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  28.89 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  28.89 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  28.89 
 
 		 429 aa  116  8.999999999999998e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  28.19 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  28.47 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  28.89 
 
 		 429 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0061  citrate synthase  27.7 
 
 		 430 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0890712  normal  0.301769 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.99 
 
 		 390 aa  115  1.0000000000000001e-24  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  27.7 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  28.47 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  27.75 
 
 		 429 aa  116  1.0000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3694  type II citrate synthase  28.18 
 
 		 428 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  27.36 
 
 		 433 aa  115  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  28.47 
 
 		 434 aa  115  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  30.45 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  28.61 
 
 		 429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  27.59 
 
 		 426 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  29.87 
 
 		 433 aa  115  2.0000000000000002e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02341  citrate synthase  27.54 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  27.93 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44070  type II citrate synthase  27.93 
 
 		 428 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0713  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.72 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.756288  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>