More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_4410 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  100 
 
 		 429 aa  877    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  58.98 
 
 		 440 aa  494  9.999999999999999e-139  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  55.05 
 
 		 427 aa  487  1e-136  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  59.04 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  57.41 
 
 		 431 aa  485  1e-136  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  54.57 
 
 		 427 aa  485  1e-136  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  59.04 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  59.04 
 
 		 434 aa  486  1e-136  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  56.15 
 
 		 432 aa  484  1e-135  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  55.29 
 
 		 427 aa  483  1e-135  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  56.94 
 
 		 437 aa  484  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  57.45 
 
 		 438 aa  484  1e-135  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  58.13 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  55.58 
 
 		 441 aa  481  1e-134  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  57.04 
 
 		 434 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2531  citrate synthase I  53.97 
 
 		 428 aa  475  1e-133  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000235775 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33600  citrate synthase  55.53 
 
 		 437 aa  473  1e-132  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.522546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  55.16 
 
 		 463 aa  469  1.0000000000000001e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  55.04 
 
 		 431 aa  466  9.999999999999999e-131  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  53 
 
 		 427 aa  462  1e-129  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2811  citrate synthase  52.62 
 
 		 427 aa  464  1e-129  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0195056  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0972  citrate synthase I  55.31 
 
 		 436 aa  461  9.999999999999999e-129  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0995  citrate synthase I  54.57 
 
 		 436 aa  459  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.620261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25990  citrate synthase  53.32 
 
 		 432 aa  457  1e-127  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  53.72 
 
 		 425 aa  453  1.0000000000000001e-126  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0803  citrate synthase I  52.61 
 
 		 440 aa  449  1e-125  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.558205 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  51.81 
 
 		 428 aa  445  1.0000000000000001e-124  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  52.45 
 
 		 450 aa  442  1e-123  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15490  citrate synthase  54.13 
 
 		 428 aa  437  1e-121  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.167286  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3584  citrate synthase I  51.59 
 
 		 425 aa  434  1e-120  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00887444 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  50.72 
 
 		 428 aa  429  1e-119  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  49.53 
 
 		 428 aa  423  1e-117  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  47.84 
 
 		 429 aa  413  1e-114  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  48.33 
 
 		 428 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  47.86 
 
 		 425 aa  403  1e-111  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  49.28 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  49.14 
 
 		 425 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1476  citrate synthase I  47.95 
 
 		 428 aa  401  9.999999999999999e-111  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.112534  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  45.58 
 
 		 426 aa  396  1e-109  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3253  type II citrate synthase  46.01 
 
 		 434 aa  395  1e-109  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  45.31 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  45.31 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  45.31 
 
 		 433 aa  394  1e-108  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0874  type II citrate synthase  47.54 
 
 		 429 aa  392  1e-108  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0015368  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2813  type II citrate synthase  45.35 
 
 		 434 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.796858 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  46.49 
 
 		 437 aa  392  1e-108  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2450  type II citrate synthase  46.55 
 
 		 434 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.444525 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1708  type II citrate synthase  45.86 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.693797  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  45.31 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  47.97 
 
 		 427 aa  394  1e-108  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  45.31 
 
 		 433 aa  392  1e-108  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  44.84 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0787  type II citrate synthase  47.78 
 
 		 429 aa  391  1e-107  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1845  type II citrate synthase  46.44 
 
 		 433 aa  389  1e-107  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.273477  normal  0.198527 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1911  citrate synthase  46.79 
 
 		 430 aa  389  1e-107  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2843  type II citrate synthase  44.73 
 
 		 434 aa  391  1e-107  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.433784  normal  0.36225 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  46.43 
 
 		 427 aa  388  1e-107  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4502  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 434 aa  390  1e-107  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.705578 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  391  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  45.07 
 
 		 433 aa  390  1e-107  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2545  citrate synthase I  45.65 
 
 		 431 aa  390  1e-107  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02359  type II citrate synthase  48.4 
 
 		 442 aa  388  1e-106  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0995  citrate synthase I  45.17 
 
 		 434 aa  386  1e-106  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.655069 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  44.06 
 
 		 433 aa  388  1e-106  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  45.76 
 
 		 437 aa  385  1e-106  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  44.13 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  44.37 
 
 		 433 aa  385  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2023  citrate synthase I  46.12 
 
 		 429 aa  388  1e-106  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  43.59 
 
 		 433 aa  387  1e-106  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3716  citrate synthase I  47.27 
 
 		 430 aa  387  1e-106  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.364105  normal  0.0570227 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  46.21 
 
 		 432 aa  388  1e-106  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  43.85 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0646  citrate synthase I  46.27 
 
 		 430 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.615558 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  45.57 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5222  citrate synthase I  45.21 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.827577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2032  citrate synthase  45.26 
 
 		 428 aa  382  1e-105  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808291  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1681  citrate synthase I  45.48 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.592991 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1301  Citrate (Si)-synthase  45.52 
 
 		 431 aa  383  1e-105  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.115082  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  45.48 
 
 		 432 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  44.37 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  46.32 
 
 		 433 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1132  citrate synthase  45.52 
 
 		 431 aa  385  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5145  citrate synthase I  44.96 
 
 		 429 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.236177  normal  0.0251581 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4425  citrate synthase I  46.55 
 
 		 436 aa  384  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.224643  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3212  citrate synthase  46.28 
 
 		 427 aa  384  1e-105  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215147  normal  0.134727 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1395  citrate synthase  45.93 
 
 		 434 aa  385  1e-105  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.322092  normal  0.0167868 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4680  citrate synthase I  44.96 
 
 		 446 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  43.85 
 
 		 436 aa  383  1e-105  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2042  type II citrate synthase  45 
 
 		 430 aa  379  1e-104  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0529149  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2417  citrate synthase I  47.14 
 
 		 447 aa  379  1e-104  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1796  type II citrate synthase  45.26 
 
 		 436 aa  380  1e-104  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.216782  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2563  type II citrate synthase  45.71 
 
 		 429 aa  379  1e-104  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.102281  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004117  citrate synthase (si)  44.81 
 
 		 429 aa  378  1e-104  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>