More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_2561 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  85.19 
 
 		 441 aa  786    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  82.88 
 
 		 440 aa  764    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  88.61 
 
 		 441 aa  816    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  81.46 
 
 		 438 aa  748    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  85.42 
 
 		 441 aa  783    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  98.87 
 
 		 441 aa  910    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  70.81 
 
 		 443 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  71.14 
 
 		 442 aa  660    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  90.93 
 
 		 454 aa  805    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  70.81 
 
 		 443 aa  662    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  70.81 
 
 		 443 aa  662    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  100 
 
 		 441 aa  919    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  72.15 
 
 		 441 aa  674    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  89.8 
 
 		 454 aa  834    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  63.82 
 
 		 434 aa  593  1e-168  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  50.23 
 
 		 439 aa  449  1e-125  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  56.49 
 
 		 399 aa  448  1e-125  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  52.34 
 
 		 466 aa  447  1.0000000000000001e-124  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  49.65 
 
 		 474 aa  429  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  47.56 
 
 		 464 aa  412  1e-114  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  47.93 
 
 		 471 aa  403  1e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  45.87 
 
 		 460 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  29.41 
 
 		 437 aa  132  1.0000000000000001e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0847  citrate synthase  28.3 
 
 		 429 aa  132  2.0000000000000002e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  29.58 
 
 		 437 aa  130  6e-29  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  30.43 
 
 		 433 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  28.69 
 
 		 375 aa  129  9.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  29.03 
 
 		 427 aa  129  1.0000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6851  type II citrate synthase  31.82 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.622921 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5205  type II citrate synthase  29.52 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.237518  normal  0.311757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2890  type II citrate synthase  30.61 
 
 		 433 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.87 
 
 		 397 aa  127  3e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  30.29 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  30.29 
 
 		 433 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  29.18 
 
 		 428 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1377  citrate synthase  27.61 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  31.32 
 
 		 440 aa  126  8.000000000000001e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1408  citrate synthase  27.61 
 
 		 386 aa  126  8.000000000000001e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  28.81 
 
 		 432 aa  125  1e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  29.51 
 
 		 433 aa  125  1e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1099  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  29.63 
 
 		 387 aa  125  1e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0404  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.39 
 
 		 378 aa  124  2e-27  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1187  citrate synthase  29.04 
 
 		 431 aa  125  2e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0858  citrate synthase I  30.28 
 
 		 433 aa  124  2e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.690144  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2111  citrate synthase  29.69 
 
 		 454 aa  124  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000226419  normal  0.855626 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  27.4 
 
 		 427 aa  125  2e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  29.27 
 
 		 433 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.78 
 
 		 409 aa  124  4e-27  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  29.04 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  29.41 
 
 		 425 aa  123  6e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0897  citrate synthase  28 
 
 		 433 aa  123  6e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0898483  normal  0.676877 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  27.11 
 
 		 389 aa  123  8e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3605  type II citrate synthase  29.34 
 
 		 436 aa  123  8e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.113528 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2194  citrate synthase I  29.28 
 
 		 429 aa  122  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.87 
 
 		 385 aa  122  9.999999999999999e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0350  citrate synthase  28.64 
 
 		 391 aa  122  9.999999999999999e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3037  type II citrate synthase  30.08 
 
 		 436 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.797011  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  27.73 
 
 		 370 aa  122  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1425  type II citrate synthase  29.2 
 
 		 436 aa  122  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  27.08 
 
 		 426 aa  121  1.9999999999999998e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  29.37 
 
 		 428 aa  120  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  30.15 
 
 		 429 aa  121  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  28.89 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  30.33 
 
 		 425 aa  121  3e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2288  type II citrate synthase  29.08 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2798  type II citrate synthase  29.08 
 
 		 436 aa  120  3.9999999999999996e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.242965 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5525  type II citrate synthase  29.44 
 
 		 432 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.615237  normal  0.487627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2701  type II citrate synthase  29.55 
 
 		 437 aa  120  3.9999999999999996e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0134767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  29.8 
 
 		 434 aa  120  6e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  28.74 
 
 		 427 aa  120  6e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2004  type II citrate synthase  29.03 
 
 		 429 aa  119  7.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.719341  normal  0.158891 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  28.15 
 
 		 438 aa  119  9e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  29.4 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  29.4 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  29.4 
 
 		 429 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  28.99 
 
 		 429 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3181  citrate synthase I  28.46 
 
 		 438 aa  118  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.270593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2320  type II citrate synthase  28.64 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2422  type II citrate synthase  29.1 
 
 		 436 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2481  type II citrate synthase  28.87 
 
 		 433 aa  118  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.523496  normal  0.0627534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  28.17 
 
 		 428 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6352  type II citrate synthase  28.87 
 
 		 433 aa  117  3e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0645718  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1134  type II citrate synthase  30.4 
 
 		 432 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.066915  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  25.81 
 
 		 446 aa  117  3e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2165  type II citrate synthase  29.26 
 
 		 437 aa  117  3e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.962895  normal  0.161655 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1991  type II citrate synthase  28.7 
 
 		 433 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.179438  normal  0.357874 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  28.35 
 
 		 437 aa  117  3.9999999999999997e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  28.39 
 
 		 428 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1528  citrate synthase  26.55 
 
 		 375 aa  117  6e-25  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0349986  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11150  citrate synthase  27.36 
 
 		 450 aa  116  6e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.592524  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>