More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_85554 on replicon NC_009048
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001302  ANIA_08275  Citrate synthase, mitochondrial Precursor (EC 2.3.3.1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O00098]  71.86 
 
 		 474 aa  673    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_85554  citrate synthase (CISY)  100 
 
 		 466 aa  947    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0177794  normal  0.167856 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00510  citrate synthase, putative  66.29 
 
 		 464 aa  622  1e-177  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.793982  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_24535  predicted protein  62.15 
 
 		 399 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0734015  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06650  2-methylcitrate synthase, mitochondrial Precursor (Methylcitrate synthase)(EC 2.3.3.5)(Citrate synthase 2) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q9TEM3]  55.07 
 
 		 460 aa  493  9.999999999999999e-139  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.353389  normal  1 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_30145  hypothetical protein  57.47 
 
 		 471 aa  493  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.542768  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6916  type I citrate synthase  58.15 
 
 		 439 aa  484  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.569416  normal  0.957775 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1124  type I citrate synthase  53.76 
 
 		 438 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1652  type I citrate synthase  52.34 
 
 		 441 aa  449  1e-125  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00794994  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3811  type I citrate synthase  52.55 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  decreased coverage  0.00120684  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3670  type I citrate synthase  52.55 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3728  type I citrate synthase  52.55 
 
 		 443 aa  448  1.0000000000000001e-124  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1379  type I citrate synthase  52.52 
 
 		 440 aa  448  1.0000000000000001e-124  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.170835  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2561  type I citrate synthase  52.34 
 
 		 441 aa  447  1.0000000000000001e-124  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.21232e-27 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2689  type I citrate synthase  52.98 
 
 		 441 aa  442  1e-123  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000255576  normal  0.147008 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1106  type I citrate synthase  52.52 
 
 		 441 aa  439  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.880837  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3798  type I citrate synthase  52.21 
 
 		 442 aa  437  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.324518 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3990  type I citrate synthase  51.64 
 
 		 454 aa  437  1e-121  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000256962 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1576  type I citrate synthase  52.21 
 
 		 441 aa  435  1e-121  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00106896  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1991  type I citrate synthase  49.65 
 
 		 434 aa  430  1e-119  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3905  type I citrate synthase  51.64 
 
 		 454 aa  407  1.0000000000000001e-112  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1134  type I citrate synthase  48.48 
 
 		 441 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000378105  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1275  citrate synthase  29.98 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.152797  normal  0.229785 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1202  Citrate (Si)-synthase  30.63 
 
 		 375 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138488  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4410  citrate synthase I  30.57 
 
 		 429 aa  130  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2679  citrate synthase  29.3 
 
 		 372 aa  125  2e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0198833  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5036  citrate synthase I  29.23 
 
 		 428 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2053  citrate synthase I  29.37 
 
 		 428 aa  123  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.655097  normal  0.0360596 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4737  Citrate synthase  26.11 
 
 		 446 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.576126  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19470  citrate synthase  28.21 
 
 		 428 aa  122  9.999999999999999e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.286826  hitchhiker  0.00826117 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0528  citrate synthase I  32.09 
 
 		 437 aa  121  3e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0708503  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5022  type II citrate synthase  31.3 
 
 		 434 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.834357 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0058  citrate synthase I  29.79 
 
 		 432 aa  118  1.9999999999999998e-25  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00358332  normal  0.0142462 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4838  type II citrate synthase  32.6 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.782916  normal  0.17167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4456  type II citrate synthase  32.6 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1245  citrate synthase  29.1 
 
 		 374 aa  118  1.9999999999999998e-25  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4543  type II citrate synthase  32.6 
 
 		 434 aa  118  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.701189 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1130  citrate synthase I  29.41 
 
 		 431 aa  117  3.9999999999999997e-25  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.684999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1729  type II citrate synthase  30.57 
 
 		 434 aa  117  6e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.540557 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1140  citrate synthase I  30.09 
 
 		 441 aa  116  6.9999999999999995e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.615799  normal  0.0294382 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0367  citrate synthase I  29 
 
 		 425 aa  116  7.999999999999999e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3253  type II citrate synthase  29.32 
 
 		 425 aa  115  2.0000000000000002e-24  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10915  type II citrate synthase  29.83 
 
 		 431 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1467  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.89 
 
 		 385 aa  115  2.0000000000000002e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0316751  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1270  citrate synthase I  31.03 
 
 		 440 aa  115  2.0000000000000002e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2287  citrate (Si)-synthase  30.64 
 
 		 425 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2284  citrate synthase I  29.75 
 
 		 427 aa  114  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.193692  normal  0.0343529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4703  citrate synthase I  31.01 
 
 		 463 aa  113  7.000000000000001e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0723  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.59 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.517524  normal  0.584309 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0855  citrate synthase I  29.12 
 
 		 432 aa  112  2.0000000000000002e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0328929  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1058  type II citrate synthase  26.27 
 
 		 437 aa  112  2.0000000000000002e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.704464  normal  0.0578787 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0969  citrate synthase I  27.82 
 
 		 427 aa  111  3e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3832  type II citrate synthase  27.96 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.418606 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3316  type II citrate synthase  27.96 
 
 		 433 aa  111  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229262  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0763  type II citrate synthase  25.67 
 
 		 437 aa  111  3e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0888  citrate synthase  26.91 
 
 		 447 aa  110  6e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.631219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0554  citrate synthase I  27.7 
 
 		 428 aa  109  9.000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488876  normal  0.835408 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2147  type II citrate synthase  27.95 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.787035  normal  0.703076 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2234  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.79 
 
 		 409 aa  109  9.000000000000001e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.709963 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3589  type II citrate synthase  27.95 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0248785  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4428  type II citrate synthase  27.95 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3939  type II citrate synthase  27.95 
 
 		 433 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29820  type II citrate synthase  28.92 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3091  citrate synthase I  27.67 
 
 		 428 aa  109  1e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.31999 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2136  citrate synthase I  28.44 
 
 		 427 aa  109  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.873392  normal  0.0485985 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1526  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  28.17 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.682888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0999  citrate synthase I  30.79 
 
 		 438 aa  109  1e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4194  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0867349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2329  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1964  citrate synthase I  29.97 
 
 		 427 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0148224  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0576  citrate (Si)-synthase  29.28 
 
 		 425 aa  108  2e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.254667  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1834  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0219356  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1744  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.676143  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4643  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1626  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00616613  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0788  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0858919  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2467  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00536833  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3765  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0679988  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1660  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 429 aa  108  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1212  citrate synthase  27.89 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00000171793  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4089  citrate synthase  26.56 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0781  citrate synthase  27.96 
 
 		 372 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05880  citrate synthase  28.08 
 
 		 428 aa  108  2e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0504  type II citrate synthase  27.66 
 
 		 433 aa  108  2e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.405584  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2257  citrate synthase I  27.55 
 
 		 431 aa  108  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.19804  normal  0.414999 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1262  type II citrate synthase  28.05 
 
 		 430 aa  108  3e-22  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.728692  normal  0.31118 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4366  type II citrate synthase  27.91 
 
 		 433 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3517  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 429 aa  108  3e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2221  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  30.5 
 
 		 377 aa  108  3e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.57744  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2224  citrate synthase I  27.78 
 
 		 425 aa  107  4e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0665  type II citrate synthase  27.36 
 
 		 433 aa  107  4e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170997  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1151  citrate synthase  27.99 
 
 		 416 aa  107  5e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  unclonable  0.00353381  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1609  type II citrate synthase  28.88 
 
 		 429 aa  107  5e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.706948  normal  0.65049 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2232  citrate synthase I  30.35 
 
 		 428 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0026  citrate synthase I  26.54 
 
 		 426 aa  107  6e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000469449  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0306  2-methylcitrate synthase/citrate synthase II  27.82 
 
 		 397 aa  106  7e-22  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.772555 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2860  citrate synthase  27.58 
 
 		 432 aa  106  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2787  citrate synthase I  27.45 
 
 		 426 aa  105  1e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.420339  normal  0.059507 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0704  citrate synthase I  26.85 
 
 		 428 aa  106  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1522  citrate synthase  25.78 
 
 		 370 aa  105  1e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.640515  normal  0.251629 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>