More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_1508 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1508  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.002925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1031  50S ribosomal protein L21  80.21 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  78.12 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1898  50S ribosomal protein L21  73.96 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0864  50S ribosomal protein L21  77.08 
 
 		 96 aa  152  2e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0834  50S ribosomal protein L21  60.42 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.420773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  46.88 
 
 		 208 aa  78.6  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 224 aa  76.6  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  74.7  0.0000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  39.18 
 
 		 102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  40.86 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 102 aa  70.1  0.00000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  40.21 
 
 		 102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  39 
 
 		 116 aa  68.2  0.00000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  38.14 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.8 
 
 		 104 aa  67.8  0.00000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  42.71 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  42.71 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  39.58 
 
 		 100 aa  65.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  35.42 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  39.39 
 
 		 103 aa  63.5  0.0000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  34.38 
 
 		 95 aa  62.8  0.000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 131 aa  61.6  0.000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  35.35 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  36 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 104 aa  60.5  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 146 aa  60.5  0.000000008  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  36.36 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  32.32 
 
 		 100 aa  60.1  0.00000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  34.29 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  38.14 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  41.24 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  37 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  31.63 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  33.33 
 
 		 223 aa  58.2  0.00000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0314  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 105 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.396717 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  35.79 
 
 		 123 aa  58.2  0.00000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 102 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  36.36 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  45.83 
 
 		 147 aa  57.4  0.00000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37 
 
 		 221 aa  57  0.00000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  32 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  31.63 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  31.63 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  31.68 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  36.84 
 
 		 101 aa  56.2  0.0000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 133 aa  56.2  0.0000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  32.65 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 105 aa  55.8  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  32 
 
 		 114 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 98 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0644  ribosomal protein L21  28.71 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.315584  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.63 
 
 		 198 aa  56.2  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 105 aa  55.5  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 140 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1113  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 118 aa  56.2  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.582987  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>