More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cla_0183 on replicon NC_012039
Organism: Campylobacter lari RM2100



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 102 aa  198  1.9999999999999998e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  89.22 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  89.22 
 
 		 102 aa  176  8e-44  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  88.24 
 
 		 102 aa  175  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  78.43 
 
 		 102 aa  160  6e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  80.2 
 
 		 104 aa  159  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0997  50S ribosomal protein L21  79.21 
 
 		 104 aa  157  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  74.51 
 
 		 102 aa  149  1e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  65.69 
 
 		 102 aa  137  6e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  61.76 
 
 		 102 aa  126  8.000000000000001e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  103  6e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  48.54 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 131 aa  95.9  2e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0979  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128697  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  46.6 
 
 		 103 aa  95.1  3e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 105 aa  94.7  4e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0895  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000281262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3125  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000193081  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3652  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3219  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000450477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  44.9 
 
 		 103 aa  94  7e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 105 aa  94  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.8  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  92.4  2e-18  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  47.96 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  44.66 
 
 		 104 aa  91.7  3e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0855  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 124 aa  91.7  3e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  91.3  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 		 102 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.5  6e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  44.12 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  90.1  9e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  89.4  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 114 aa  89.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  45.63 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  89  2e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 104 aa  88.6  2e-17  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 188 aa  89  2e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  88.6  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  45 
 
 		 129 aa  88.2  4e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 136 aa  87.8  5e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 102 aa  87.4  6e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  87.4  6e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 102 aa  87  9e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  86.3  1e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  41.75 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  42.72 
 
 		 103 aa  86.7  1e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>