More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1711 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1898  50S ribosomal protein L21  74.75 
 
 		 99 aa  157  3e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673127  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0864  50S ribosomal protein L21  78.12 
 
 		 96 aa  156  1e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242975  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1508  50S ribosomal protein L21  78.12 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.002925  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1031  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  69.79 
 
 		 96 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0834  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  117  6e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.420773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 224 aa  78.6  0.00000000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  40.59 
 
 		 104 aa  77.4  0.00000000000006  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  73.9  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  73.6  0.0000000000009  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  73.6  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  71.2  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  41.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  41.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 131 aa  68.9  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  38.14 
 
 		 95 aa  68.6  0.00000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  68.2  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  37.89 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 102 aa  67  0.00000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  39.8 
 
 		 221 aa  66.2  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  65.5  0.0000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 102 aa  66.2  0.0000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.63 
 
 		 198 aa  65.5  0.0000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.63 
 
 		 258 aa  65.1  0.0000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  65.1  0.0000000003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  34.65 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  37 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  31.37 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  64.3  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  63.5  0.0000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 98 aa  63.2  0.000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  37.25 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 102 aa  62.8  0.000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 107 aa  62.4  0.000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 114 aa  62.4  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1751  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000842566  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  61.6  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  33.67 
 
 		 100 aa  62  0.000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  62  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  36.08 
 
 		 120 aa  61.6  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  29.7 
 
 		 149 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3550  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3555  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.786701  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3623  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  60.8  0.000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  30.61 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  36 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  35.71 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3891  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.428524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  36.08 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  58.9  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 140 aa  58.9  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>