More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_1898 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_1898  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 99 aa  203  6e-52  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673127  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1031  50S ribosomal protein L21  77.08 
 
 		 96 aa  159  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  74.75 
 
 		 99 aa  157  3e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1508  50S ribosomal protein L21  73.96 
 
 		 96 aa  155  2e-37  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.002925  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0864  50S ribosomal protein L21  70.83 
 
 		 96 aa  142  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  65.62 
 
 		 96 aa  140  8e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0834  50S ribosomal protein L21  62.5 
 
 		 96 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.420773  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  38 
 
 		 116 aa  72  0.000000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  37.76 
 
 		 104 aa  69.7  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 102 aa  68.6  0.00000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  67.8  0.00000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  37.11 
 
 		 100 aa  67  0.00000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  66.6  0.0000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  37.5 
 
 		 95 aa  66.2  0.0000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 103 aa  66.6  0.0000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  38.83 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  36.08 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  36.08 
 
 		 102 aa  64.7  0.0000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  40.82 
 
 		 131 aa  64.7  0.0000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 208 aa  63.9  0.0000000007  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  36.67 
 
 		 102 aa  63.9  0.0000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 102 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  36.27 
 
 		 146 aa  63.5  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  62  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 104 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 102 aa  62  0.000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  41.41 
 
 		 96 aa  62.4  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  39 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  59.7  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  36 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 114 aa  59.3  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  31.73 
 
 		 114 aa  58.9  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  35.71 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  34.34 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  32.65 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  32.99 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  36.19 
 
 		 104 aa  58.2  0.00000004  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  32.99 
 
 		 120 aa  58.2  0.00000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1503  50S ribosomal protein L21  29 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0308225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  34.34 
 
 		 99 aa  57.4  0.00000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  30.1 
 
 		 104 aa  57  0.00000007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  35.71 
 
 		 104 aa  56.2  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  37 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 130 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  29.41 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 136 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2635  50S ribosomal protein L21  30.39 
 
 		 107 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.159083  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  28 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 123 aa  56.2  0.0000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1473  ribosomal protein L21  28.57 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.447954  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  35.71 
 
 		 140 aa  55.5  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  32.04 
 
 		 121 aa  55.1  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  55.5  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1622  ribosomal protein L21  31.31 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.823278  normal  0.700415 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  31.63 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1220  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 105 aa  54.3  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.61221 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  33.66 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  30 
 
 		 104 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  29.7 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  29.7 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2927  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000789228  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  28.71 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  28.71 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 98 aa  53.5  0.0000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 131 aa  53.9  0.0000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>