More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1601 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 96 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  69.79 
 
 		 99 aa  144  4.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1031  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0864  50S ribosomal protein L21  70.83 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242975  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1898  50S ribosomal protein L21  65.62 
 
 		 99 aa  140  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673127  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1508  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  139  9.999999999999999e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.002925  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0834  50S ribosomal protein L21  77.08 
 
 		 96 aa  133  8e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.420773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  41.84 
 
 		 103 aa  83.6  9e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 104 aa  76.3  0.0000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 224 aa  74.7  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 104 aa  71.2  0.000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  37.76 
 
 		 104 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  39.58 
 
 		 208 aa  70.5  0.000000000006  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  36.46 
 
 		 95 aa  69.7  0.00000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  36.46 
 
 		 103 aa  67  0.00000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  38.38 
 
 		 104 aa  65.9  0.0000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  41.67 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  41.67 
 
 		 103 aa  66.2  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  65.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 103 aa  65.1  0.0000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  38.38 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  38.38 
 
 		 139 aa  64.7  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 146 aa  64.3  0.0000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 104 aa  63.9  0.0000000008  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  38.38 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 131 aa  62.8  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1320  50S ribosomal protein L21  39.8 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0375246  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  35 
 
 		 133 aa  61.6  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  36 
 
 		 116 aa  61.6  0.000000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  34.02 
 
 		 100 aa  61.2  0.000000005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 102 aa  60.8  0.000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  36.56 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  36.56 
 
 		 102 aa  60.5  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 114 aa  60.5  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  36.56 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  59.7  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18270  LSU ribosomal protein L21P  30.61 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0755051  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  33.67 
 
 		 103 aa  59.3  0.00000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  35.71 
 
 		 136 aa  58.9  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  34.69 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  31.31 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  42.42 
 
 		 105 aa  58.9  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  36.84 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  34.34 
 
 		 99 aa  58.5  0.00000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  58.2  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 104 aa  58.5  0.00000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2013  ribosomal protein L21  39 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.00000000281642  unclonable  3.79334e-16 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  34.69 
 
 		 258 aa  58.2  0.00000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  35.35 
 
 		 125 aa  57.8  0.00000005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  41 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  29 
 
 		 149 aa  57.4  0.00000007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 140 aa  57.4  0.00000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0089  50S ribosomal protein L21  38.14 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.199465  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0129  50S ribosomal protein L21  38.14 
 
 		 102 aa  57  0.00000008  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  34.95 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2670  50S ribosomal protein L21  34.74 
 
 		 123 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000122926  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 104 aa  57  0.00000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 131 aa  56.2  0.0000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  40 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  56.6  0.0000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2695  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 120 aa  55.8  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000171739  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  33.67 
 
 		 198 aa  55.8  0.0000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0098  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2228  50S ribosomal protein L21  34.02 
 
 		 101 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0036789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0839  ribosomal protein L21  31.63 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.0819000000000001e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 98 aa  55.1  0.0000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  34.38 
 
 		 102 aa  55.1  0.0000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  40.62 
 
 		 147 aa  54.3  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11540  LSU ribosomal protein L21P  27 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.536091  normal  0.231527 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  34.38 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  31.63 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  30.61 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  32.99 
 
 		 164 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>