More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0546 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_0546  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 125 aa  255  1e-67  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.797302  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2127  50S ribosomal protein L21  86.29 
 
 		 121 aa  217  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.389677 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05411  50S ribosomal protein L21  80.53 
 
 		 133 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0915  50S ribosomal protein L21  69.42 
 
 		 139 aa  179  8.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17711  50S ribosomal protein L21  69.42 
 
 		 139 aa  179  9.000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0269393  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_13981  50S ribosomal protein L21  70.09 
 
 		 170 aa  169  1e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.510472 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1442  50S ribosomal protein L21  60.19 
 
 		 146 aa  147  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15451  50S ribosomal protein L21  60 
 
 		 166 aa  144  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.946865  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15051  50S ribosomal protein L21  58.25 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.645106  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15301  50S ribosomal protein L21  59.05 
 
 		 146 aa  141  3e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0646  50S ribosomal protein L21  53.77 
 
 		 130 aa  124  5e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.362263  normal  0.661162 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1219  50S ribosomal protein L21  62.04 
 
 		 127 aa  106  1e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1516  50S ribosomal protein L21  48.15 
 
 		 130 aa  94  6e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00385929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0423  50S ribosomal protein L21  49.53 
 
 		 135 aa  90.9  5e-18  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.984007  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2771  50S ribosomal protein L21  52.78 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.196084  normal  0.0693096 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3346  50S ribosomal protein L21  52.78 
 
 		 123 aa  90.5  7e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3466  50S ribosomal protein L21  51.38 
 
 		 136 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.302782 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  41.35 
 
 		 224 aa  87.8  4e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 104 aa  87  7e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  41 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3243  50S ribosomal protein L21P  50.47 
 
 		 136 aa  86.7  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  37.5 
 
 		 105 aa  85.1  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.2 
 
 		 104 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  36.21 
 
 		 146 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  81.6  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2481  ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 105 aa  81.3  0.000000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.726202  normal  0.224153 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  43 
 
 		 103 aa  81.3  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 114 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35695  predicted protein  39 
 
 		 103 aa  80.1  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00157313  normal  0.015942 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 208 aa  80.1  0.00000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  39.6 
 
 		 102 aa  79.7  0.00000000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1624  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  80.1  0.00000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.511326 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  39.6 
 
 		 103 aa  77.4  0.00000000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 102 aa  77.4  0.00000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 104 aa  77  0.00000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  39 
 
 		 103 aa  75.5  0.0000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 104 aa  75.1  0.0000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1281  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 105 aa  74.7  0.0000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00406184  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  74.3  0.0000000000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  36.63 
 
 		 100 aa  73.9  0.0000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1545  50S ribosomal protein L21  40 
 
 		 147 aa  73.6  0.0000000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 132 aa  73.6  0.0000000000009  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  34 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  36.54 
 
 		 104 aa  73.2  0.000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  73.2  0.000000000001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0908  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2653  ribosomal protein L21  38.24 
 
 		 102 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000000599107  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1724  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 		 104 aa  72.4  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 		 103 aa  72.8  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1107  ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 134 aa  72  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000212125  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  39.22 
 
 		 103 aa  72  0.000000000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  71.6  0.000000000003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1036  50S ribosomal protein L21  38.46 
 
 		 106 aa  71.6  0.000000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0850957  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1325  50S ribosomal protein L21  32.41 
 
 		 132 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000243577  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1136  50S ribosomal protein L21  32.41 
 
 		 134 aa  71.2  0.000000000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000463579  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  34 
 
 		 103 aa  70.5  0.000000000007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  37.5 
 
 		 230 aa  70.1  0.000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  70.1  0.000000000009  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4512  ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  31.68 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0891  50S ribosomal protein L21  34.31 
 
 		 103 aa  70.1  0.00000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0723214 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  29.7 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  33.33 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 104 aa  68.9  0.00000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  39 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  32 
 
 		 125 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  68.9  0.00000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  31 
 
 		 104 aa  69.3  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>