More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1031 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1031  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 96 aa  196  9e-50  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00139927  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1508  50S ribosomal protein L21  80.21 
 
 		 96 aa  167  3e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.002925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1898  50S ribosomal protein L21  77.08 
 
 		 99 aa  159  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.673127  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1711  50S ribosomal protein L21  75 
 
 		 99 aa  155  2e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.237859  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0864  50S ribosomal protein L21  76.04 
 
 		 96 aa  153  6e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.242975  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1601  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  142  2e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0834  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 96 aa  115  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.420773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1465  50S ribosomal protein L21  42.71 
 
 		 208 aa  73.6  0.000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  40.21 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  38 
 
 		 102 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4884  ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 103 aa  70.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.125132  normal  0.112158 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  37.76 
 
 		 104 aa  70.1  0.00000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 102 aa  68.2  0.00000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  38.71 
 
 		 102 aa  67.4  0.00000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 102 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 224 aa  66.2  0.0000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  35 
 
 		 116 aa  64.7  0.0000000004  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  38.54 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  38.54 
 
 		 103 aa  64.7  0.0000000004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0090  ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 104 aa  64.3  0.0000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.0253014 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  36.63 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 104 aa  62.8  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 104 aa  63.5  0.000000001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  62.8  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  61.6  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 103 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  41.18 
 
 		 104 aa  60.8  0.000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1525  50S ribosomal protein L21P  36.46 
 
 		 95 aa  60.8  0.000000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.434446  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  37.37 
 
 		 131 aa  60.5  0.000000008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 114 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0107  50S ribosomal protein L21  34.38 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 103 aa  60.1  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  37.5 
 
 		 96 aa  60.1  0.00000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4338  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  2.9959e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0183  50S ribosomal protein L21  37 
 
 		 102 aa  59.3  0.00000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1547  ribosomal protein L21  32 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00649345  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  38 
 
 		 221 aa  58.9  0.00000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3860  50S ribosomal protein L21  31 
 
 		 104 aa  58.9  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.494597  hitchhiker  0.00226444 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  34 
 
 		 102 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  30.39 
 
 		 103 aa  58.5  0.00000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  57.8  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  36.73 
 
 		 136 aa  57.4  0.00000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2664  ribosomal protein L21  31 
 
 		 114 aa  57  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.341315 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  32.99 
 
 		 102 aa  57.4  0.00000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  30.93 
 
 		 100 aa  57.4  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  37.76 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3481  50S ribosomal protein L21  30 
 
 		 104 aa  57.4  0.00000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0592403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  34.34 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  33.66 
 
 		 198 aa  57  0.00000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  37.11 
 
 		 102 aa  57  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  33 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  37.14 
 
 		 102 aa  56.2  0.0000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  34 
 
 		 101 aa  56.6  0.0000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3451  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 102 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.147626  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  35.05 
 
 		 102 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  33.66 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  31.68 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2047  ribosomal protein L21  34.38 
 
 		 100 aa  56.2  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  31.68 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12469  50S ribosomal protein L21  30.61 
 
 		 104 aa  55.1  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0103879  normal  0.999566 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2001  50S ribosomal protein L21  29.9 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0536247  normal  0.99837 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  33.67 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  55.5  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7271  50S ribosomal protein L21P  31.96 
 
 		 100 aa  54.7  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.60592  normal  0.0840523 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  32.67 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  29.7 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  29.59 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  38.78 
 
 		 98 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  35.64 
 
 		 258 aa  54.3  0.0000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  34.69 
 
 		 131 aa  54.3  0.0000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  30.69 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  33.67 
 
 		 103 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  28 
 
 		 102 aa  54.3  0.0000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>