More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_0109 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_0109  ribosomal protein L21  100 
 
 
96 aa  189  1e-47  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000117318  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0179  ribosomal protein L21  48 
 
 
102 aa  85.9  2e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000183343  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2117  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 
104 aa  85.9  2e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.00000000135569  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
102 aa  81.6  0.000000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 
103 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 
103 aa  80.5  0.000000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 
103 aa  79.3  0.00000000000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  48.51 
 
 
156 aa  78.2  0.00000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
132 aa  77.8  0.00000000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  77  0.00000000000007  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  77  0.00000000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 
104 aa  76.3  0.0000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  46.39 
 
 
102 aa  75.5  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0763  50S ribosomal protein L21  49.47 
 
 
96 aa  75.9  0.0000000000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  9.31666e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0018  50S ribosomal protein L21  41.84 
 
 
131 aa  75.5  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13000  LSU ribosomal protein L21P  47.47 
 
 
106 aa  75.1  0.0000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000143169  normal  0.099784 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1118  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 
146 aa  75.1  0.0000000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00565538  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 
103 aa  74.7  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  44.55 
 
 
105 aa  74.7  0.0000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  44.55 
 
 
104 aa  73.9  0.0000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  43.56 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  73.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  44.33 
 
 
102 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
104 aa  73.2  0.000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  42.57 
 
 
103 aa  72.8  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
104 aa  73.6  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  43.14 
 
 
104 aa  72.4  0.000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 
103 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5208  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.123983  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4860  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.6007 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  43 
 
 
102 aa  72  0.000000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3315  ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000262091  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0869  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000245664  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60460  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0123186 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
104 aa  71.2  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  42.57 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40790  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  71.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.200722  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  42.16 
 
 
104 aa  70.9  0.000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
102 aa  70.9  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  70.9  0.000000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  42.27 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  40.59 
 
 
114 aa  70.5  0.000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0502  ribosomal protein L21  42 
 
 
102 aa  70.5  0.000000000008  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3323  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000033092  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1036  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000168941  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3682  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.885821  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0967  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000186548  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0245  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000000276317  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3360  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000107263  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1069  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  70.5  0.000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000190707  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  41.58 
 
 
103 aa  70.1  0.000000000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43 
 
 
102 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0954  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  69.7  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.361102  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0473  50S ribosomal protein L21  35.64 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.0000000000637379  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0558  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000282146  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3479  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.00000647108  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0793  50S ribosomal protein L21  37.62 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000236829  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0852  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000265275  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4497  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.200456  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3195  50S ribosomal protein L21  49.48 
 
 
102 aa  68.9  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  9.73006e-17  unclonable  7.71694e-24 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  40 
 
 
116 aa  68.9  0.00000000002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  40 
 
 
102 aa  69.3  0.00000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1119  50S ribosomal protein L21  41 
 
 
105 aa  68.9  0.00000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  38.61 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  34.65 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03731  50S ribosomal protein L21  36.63 
 
 
103 aa  69.3  0.00000000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000230006  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0720  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.7553  normal  0.901329 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0720  50S ribosomal protein L21  42 
 
 
104 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.456821  normal  0.0127169 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2829  50S ribosomal protein L21  39.6 
 
 
103 aa  68.2  0.00000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000000650093  normal  0.344337 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>