More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3891 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3891  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 120 aa  235  1e-61  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.428524  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2041  50S ribosomal protein L21  83.67 
 
 		 164 aa  141  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.214914 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0929  50S ribosomal protein L21  79.38 
 
 		 98 aa  130  6.999999999999999e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  52.48 
 
 		 223 aa  107  5e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 105 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  53.4 
 
 		 103 aa  106  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 124 aa  105  2e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 105 aa  105  2e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  104  5e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.98 
 
 		 103 aa  103  9e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  47.71 
 
 		 171 aa  103  9e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  49.49 
 
 		 100 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 188 aa  102  1e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  55.34 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  52.58 
 
 		 142 aa  102  2e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0557  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 104 aa  101  3e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  49.5 
 
 		 104 aa  100  5e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  47.66 
 
 		 157 aa  100  5e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  51.55 
 
 		 129 aa  100  8e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 104 aa  99.4  1e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  99.8  1e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  51.49 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 131 aa  99.4  2e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  97.4  6e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3106  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.744005  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 125 aa  96.3  1e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  48.82 
 
 		 136 aa  96.3  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  95.5  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  95.9  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50.5 
 
 		 198 aa  95.1  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0212  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.237362 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  45.67 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  94  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  43.8 
 
 		 140 aa  94  6e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 104 aa  93.6  8e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  51 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  93.6  9e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  45.67 
 
 		 131 aa  93.6  9e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.98 
 
 		 221 aa  93.2  1e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3917  ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00841206 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0511  50S ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0526818 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 104 aa  90.9  5e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  90.9  6e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 102 aa  90.5  7e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  90.5  8e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2652  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  90.1  8e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0214685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  49.02 
 
 		 102 aa  89.4  1e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  48 
 
 		 102 aa  89.7  1e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  90.1  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  48.04 
 
 		 149 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0507  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.369582  normal  0.527272 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3449  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  89.7  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00752607  hitchhiker  0.00404832 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  48 
 
 		 101 aa  90.1  1e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  53.92 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  47.37 
 
 		 116 aa  89  2e-17  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5480  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 104 aa  89  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0264938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  89.4  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  88.6  3e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  88.2  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 102 aa  88.2  4e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0509  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00322629  normal  0.760659 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0551  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000001032  normal  0.0263071 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3666  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000619372  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2802  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000188755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0099  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.0000205057  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  49.14 
 
 		 130 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0484  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00989792  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0581  50S ribosomal protein L21  41.58 
 
 		 103 aa  87.8  5e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000178483  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1305  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2523  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.444595  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3258  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3490  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.761621  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 105 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1140  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3526  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.248668  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.6 
 
 		 258 aa  86.3  1e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  49.14 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0446  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 103 aa  86.3  1e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  49.14 
 
 		 130 aa  86.7  1e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 104 aa  85.5  2e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2216  50S ribosomal protein L21  46.94 
 
 		 99 aa  85.5  2e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.824746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  46.46 
 
 		 102 aa  85.9  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>