More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3794 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3794  Cysteine desulfurase  100 
 
 		 383 aa  780    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.567402  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0302  cysteine desulfurase NifS  39.28 
 
 		 392 aa  287  2.9999999999999996e-76  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0467605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0772  cysteine desulfurase  36.58 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1164  cysteine desulfurase  36.58 
 
 		 384 aa  268  1e-70  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3581  cysteine desulfurase NifS  38.06 
 
 		 400 aa  266  4e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.345313  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2683  aminotransferase, class V  39.31 
 
 		 393 aa  264  2e-69  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0397114 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1652  aminotransferase, class V  38.06 
 
 		 392 aa  262  8.999999999999999e-69  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.143138  hitchhiker  0.00767612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3914  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  38.68 
 
 		 400 aa  261  1e-68  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0050  cysteine desulfurase  37.89 
 
 		 407 aa  260  2e-68  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0872  aminotransferase, class V  38.64 
 
 		 382 aa  259  8e-68  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2570  cysteine desulfurase  38.32 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0100  cysteine desulfurase NifS  39.58 
 
 		 400 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.873822 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2659  cysteine desulfurase NifS  37.43 
 
 		 404 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.614192 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08880  aminotransferase class V  37.27 
 
 		 392 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.80371e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3569  aminotransferase class V  39.59 
 
 		 388 aa  253  3e-66  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00955537  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1833  aminotransferase, class V  38.48 
 
 		 389 aa  253  4.0000000000000004e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0175075  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1493  aminotransferase, class V  36.72 
 
 		 379 aa  253  5.000000000000001e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0268467  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1356  cysteine desulfurase NifS  37.99 
 
 		 402 aa  253  6e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0207  cysteine desulfurase NifS  37.76 
 
 		 388 aa  252  8.000000000000001e-66  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.0000531678  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0206  IscS protein  37.02 
 
 		 397 aa  251  1e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.264012  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3201  cysteine desulphurase  37.66 
 
 		 396 aa  250  2e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.11568  normal  0.0184494 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3884  aminotransferase class V  37.17 
 
 		 398 aa  251  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00981578  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0981  aminotransferase, class V  39.79 
 
 		 407 aa  251  2e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.318228 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0719  cysteine desulfurase NifS  36.84 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2498  aminotransferase class V  37.6 
 
 		 381 aa  250  4e-65  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2213  aminotransferase, class V  37.37 
 
 		 398 aa  249  5e-65  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.506383 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2362  cysteine desulfurase NifS  39.05 
 
 		 399 aa  249  5e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1075  cysteine desulfurase NifS  37.63 
 
 		 384 aa  249  5e-65  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3063  aminotransferase, class V  39.53 
 
 		 383 aa  249  8e-65  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0588987  unclonable  0.000000817205 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2015  aminotransferase, class V  38.22 
 
 		 391 aa  248  9e-65  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118596  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2011  cysteine desulfurase  39.06 
 
 		 391 aa  248  1e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.079673  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1860  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  37.08 
 
 		 396 aa  248  1e-64  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000140569  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4134  aminotransferase, class V  36.94 
 
 		 400 aa  248  1e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0486971  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0437  cysteine desulfurase NifS  37.01 
 
 		 386 aa  248  2e-64  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.361233 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1649  aminotransferase, class V  39.31 
 
 		 385 aa  247  2e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.251188  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5089  cysteine desulfurase NifS  39.37 
 
 		 410 aa  247  3e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0992  cysteine desulfurase  37.24 
 
 		 391 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00026474  normal  0.256714 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4255  aminotransferase, class V  38.82 
 
 		 422 aa  245  8e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0266  hypothetical protein  36.13 
 
 		 393 aa  245  9e-64  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.423514  normal  0.267621 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2630  aminotransferase class V  40.54 
 
 		 1143 aa  245  9.999999999999999e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01630  Nitrogen fixation cysteine desulfurase, nifS  36.98 
 
 		 402 aa  244  1.9999999999999999e-63  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2424  cysteine desulphurase  35.77 
 
 		 404 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1085  aminotransferase, class V  39.27 
 
 		 407 aa  244  1.9999999999999999e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1569  cysteine desulfurase NifS  38.22 
 
 		 389 aa  244  1.9999999999999999e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00349258  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2647  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 389 aa  243  3e-63  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00311085 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0365  aminotransferase class V  35.73 
 
 		 401 aa  244  3e-63  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0437125  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4451  aminotransferase, class V  38.85 
 
 		 397 aa  242  7e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1811  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1783  cysteine desulfurase NifS  38.48 
 
 		 401 aa  242  7e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1104  aminotransferase class V  42.52 
 
 		 381 aa  242  9e-63  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.141104  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1607  cysteine desulfurase NifS  38.16 
 
 		 388 aa  242  1e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.76832  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3109  aminotransferase class V  36.91 
 
 		 381 aa  241  2e-62  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.00030249  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2907  cysteine desulfurase NifS  35.17 
 
 		 398 aa  240  2e-62  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000201074  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0173  aminotransferase class V  34.29 
 
 		 382 aa  241  2e-62  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1486  cysteine desulfurase/aminotransferase, IscS/NifS family  38.08 
 
 		 392 aa  241  2e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8110  Cysteine desulfurase  37.34 
 
 		 387 aa  240  2.9999999999999997e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2274  cysteine desulfurase NifS  35.7 
 
 		 402 aa  240  2.9999999999999997e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.363972  hitchhiker  0.00000604426 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1515  aminotransferase, class V:aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.27 
 
 		 404 aa  239  5e-62  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.894831  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6046  aminotransferase class V  38.12 
 
 		 391 aa  239  5.999999999999999e-62  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0720  aminotransferase, class V  34.29 
 
 		 394 aa  239  6.999999999999999e-62  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00090765  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1939  aminotransferase class V  36.65 
 
 		 388 aa  239  6.999999999999999e-62  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00024706 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0688  cysteine desulfurase NifS  35.17 
 
 		 388 aa  239  9e-62  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0297222  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0341  cysteine desulfurase  35.88 
 
 		 388 aa  238  1e-61  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2039  cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1755  cysteine desulfurase  34.12 
 
 		 398 aa  238  1e-61  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00778501  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2125  aminotransferase, class V  34.64 
 
 		 398 aa  237  2e-61  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.573036  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3781  aminotransferase class V  37.82 
 
 		 391 aa  237  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.559401  normal  0.819909 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0595  putative pyridoxal-phosphate-dependent aminotransferase  38.95 
 
 		 390 aa  236  3e-61  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08620  cysteine desulfurase family protein  37.6 
 
 		 398 aa  237  3e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.702147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0688  aminotransferase, class V  36.73 
 
 		 418 aa  237  3e-61  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.446364  normal  0.630962 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1714  cysteine desulfurase NifS  33.85 
 
 		 394 aa  237  3e-61  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000384465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0953  Cysteine desulfurase  37.08 
 
 		 380 aa  236  4e-61  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0235  IscS protein  34.96 
 
 		 398 aa  236  5.0000000000000005e-61  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0423  cysteine desulfurase NifS  35.84 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0763464  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4480  aminotransferase, class V  35.79 
 
 		 381 aa  236  6e-61  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.921351  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2363  aminotransferase, class V  36.04 
 
 		 398 aa  236  6e-61  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197402  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4517  aminotransferase, class V  36.05 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0024603  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4244  aminotransferase class V  36.05 
 
 		 381 aa  235  8e-61  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00204023  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3620  cysteine desulfurase NifS  38.42 
 
 		 400 aa  235  9e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.190149 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1949  aminotransferase, class V  35.71 
 
 		 385 aa  235  1.0000000000000001e-60  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000781244  normal  0.177382 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4245  aromatic amino acid beta-eliminating lyase/threonine aldolase  37.63 
 
 		 398 aa  235  1.0000000000000001e-60  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2275  aminotransferase, class V  36.98 
 
 		 386 aa  235  1.0000000000000001e-60  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0624  aminotransferase, class V  37.66 
 
 		 385 aa  234  1.0000000000000001e-60  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00292698 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2002  aminotransferase class V  36.79 
 
 		 401 aa  234  2.0000000000000002e-60  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.557544 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4129  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00019108  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4530  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000702151  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4477  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 381 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.508200000000001e-19 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3446  aminotransferase, class V  36.41 
 
 		 399 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.311876  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4140  aminotransferase, class V  35.53 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000996508  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0719  aminotransferase, class V  35.79 
 
 		 381 aa  234  3e-60  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000547846  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1558  cysteine desulfurase NifS  36.81 
 
 		 400 aa  233  3e-60  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0572612  normal  0.890663 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1343  aminotransferase class V  35.53 
 
 		 389 aa  234  3e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1837  cysteine desulfurase NifS  35.94 
 
 		 396 aa  234  3e-60  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0935929 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1872  aminotransferase, class V  36.06 
 
 		 400 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.175027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2105  aminotransferase, class V  37.89 
 
 		 397 aa  232  7.000000000000001e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2232  aminotransferase class V  36.43 
 
 		 401 aa  232  8.000000000000001e-60  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1302  aminotransferase class V  37.37 
 
 		 390 aa  232  1e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2295  aminotransferase class V  37.11 
 
 		 394 aa  231  2e-59  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0121543 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1696  cysteine desulfurase  37.82 
 
 		 396 aa  231  2e-59  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1175  aminotransferase class V  42.26 
 
 		 381 aa  231  2e-59  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>