More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2778 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2778  protein-methionine-S-oxide reductase  100 
 
 		 155 aa  318  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1080  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 164 aa  147  4e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.197554  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2452  methionine sulfoxide reductase A  44.37 
 
 		 158 aa  144  6e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2709  methionine sulfoxide reductase A  44.22 
 
 		 162 aa  142  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2013  methionine sulfoxide reductase A  43.87 
 
 		 156 aa  141  3e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.808571  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2160  peptide methionine sulfoxide reductase  39.87 
 
 		 163 aa  140  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2815  methionine sulfoxide reductase A  43.23 
 
 		 181 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0725435  normal  0.0472359 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2779  peptide methionine sulfoxide reductase  43.51 
 
 		 185 aa  138  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220977 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1246  peptide methionine sulfoxide reductase  46 
 
 		 155 aa  137  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0222  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  41.67 
 
 		 311 aa  134  3.0000000000000003e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.763171  hitchhiker  3.90951e-21 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3161  methionine sulfoxide reductase A  42.48 
 
 		 162 aa  134  5e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0995  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 		 150 aa  134  7.000000000000001e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.760428 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0268  methionine sulfoxide reductase A  41.4 
 
 		 162 aa  133  8e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3782  methionine sulfoxide reductase A  42.18 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0971  methionine sulfoxide reductase A  44.44 
 
 		 179 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.840251 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2248  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 159 aa  130  6.999999999999999e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.423896  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0099  methionine sulfoxide reductase A  41.33 
 
 		 168 aa  130  6.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101937  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1784  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 		 159 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0781853  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  43.23 
 
 		 165 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5572  methionine sulfoxide reductase A  40.79 
 
 		 168 aa  128  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.974641  normal  0.0628347 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2938  methionine sulfoxide reductase A  45.1 
 
 		 179 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3737  methionine sulfoxide reductase A  40.91 
 
 		 175 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1002  methionine sulfoxide reductase A  40.26 
 
 		 167 aa  128  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0476  peptide methionine sulfoxide reductase  41.61 
 
 		 208 aa  127  6e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.825403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2331  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 159 aa  127  6e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000860264 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2967  methionine sulfoxide reductase A  42 
 
 		 170 aa  127  7.000000000000001e-29  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1883  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 159 aa  127  8.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.125399  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2782  methionine sulfoxide reductase A  41.83 
 
 		 169 aa  126  1.0000000000000001e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.902177  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2237  peptide methionine sulfoxide reductase  41.56 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00174935  hitchhiker  0.0000000561998 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2736  peptide methionine sulfoxide reductase  42.57 
 
 		 183 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.144073  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0163  methionine sulfoxide reductase A  40.52 
 
 		 172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.22349  normal  0.399743 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2197  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 159 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00496767  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2328  peptide methionine sulfoxide reductase  40.82 
 
 		 153 aa  125  3e-28  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2362  protein-methionine-S-oxide reductase  46.21 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1707  protein-methionine-S-oxide reductase  40.26 
 
 		 164 aa  124  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.278278  normal  0.0525727 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2224  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00824417  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6581  methionine sulfoxide reductase A  41.18 
 
 		 169 aa  124  6e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.126192  normal  0.186636 
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4510  hypothetical protein  40.91 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2337  peptide methionine sulfoxide reductase  39.61 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2276  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00119018  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2147  peptide methionine sulfoxide reductase  40.91 
 
 		 159 aa  124  7e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000222144  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1933  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 159 aa  123  7e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000000516895  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0126  methionine sulfoxide reductase A  40.13 
 
 		 171 aa  123  8.000000000000001e-28  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.140688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2030  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0104989  hitchhiker  0.000138041 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1945  peptide methionine sulfoxide reductase  40 
 
 		 159 aa  123  9e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00147919 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4158  methionine sulfoxide reductase A  40.79 
 
 		 167 aa  122  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0562  methionine sulfoxide reductase A  43.71 
 
 		 168 aa  122  1e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0870  methionine sulfoxide reductase A  43.71 
 
 		 177 aa  122  2e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2133  peptide methionine sulfoxide reductase  38.96 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.858192  hitchhiker  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0128  methionine sulfoxide reductase A  39.47 
 
 		 179 aa  122  2e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  hitchhiker  0.00332442  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1923  peptide methionine sulfoxide reductase  40.26 
 
 		 159 aa  121  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199539 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0600  Peptide-methionine (S)-S-oxide reductase  44.03 
 
 		 229 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4156  methionine sulfoxide reductase A  41.06 
 
 		 168 aa  121  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4557  methionine sulfoxide reductase A  42.67 
 
 		 168 aa  120  5e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.7184  normal  0.0914817 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1380  peptide methionine sulfoxide reductase  44.44 
 
 		 180 aa  120  6e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3784  methionine sulfoxide reductase A  41.06 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3069  methionine sulfoxide reductase A  38.67 
 
 		 166 aa  119  9.999999999999999e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.106542  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3544  peptide methionine sulfoxide reductase  39.24 
 
 		 186 aa  119  9.999999999999999e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6171  methionine sulfoxide reductase A  39.87 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.581764  normal  0.0109855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10138  methionine sulfoxide reductase A  39.74 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3100  peptide methionine sulfoxide reductase  39.86 
 
 		 184 aa  119  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.159338 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6406  methionine sulfoxide reductase A  39.87 
 
 		 168 aa  119  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0595375  normal  0.568144 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1649  peptide methionine sulfoxide reductase  34.78 
 
 		 266 aa  119  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000349761  normal  0.22298 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0298  peptide methionine sulfoxide reductase  44.37 
 
 		 220 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.998746  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0249  peptide methionine sulfoxide reductase  41.89 
 
 		 214 aa  118  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000294417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4138  methionine sulfoxide reductase A  41.06 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2296  methionine sulfoxide reductase A  40.4 
 
 		 168 aa  118  3e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5337  peptide methionine sulfoxide reductase  40.97 
 
 		 225 aa  117  4.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5202  peptide methionine sulfoxide reductase  41.03 
 
 		 180 aa  117  4.9999999999999996e-26  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2540  peptide methionine sulfoxide reductase  42.41 
 
 		 220 aa  117  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1750  methionine sulfoxide reductase A  38.46 
 
 		 180 aa  117  7e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0109887  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2804  methionine sulfoxide reductase A  39.07 
 
 		 171 aa  117  7e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.961947  normal  0.595065 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1055  peptide methionine sulfoxide reductase  39.73 
 
 		 178 aa  116  9.999999999999999e-26  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.300876  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3755  peptide methionine sulfoxide reductase  39.04 
 
 		 228 aa  116  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0435516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0324  methionine sulfoxide reductase A  41.06 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3627  peptide methionine sulfoxide reductase  39.74 
 
 		 219 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0420893 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0616  peptide methionine sulfoxide reductase  39.19 
 
 		 181 aa  115  1.9999999999999998e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0133575 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0652  peptide methionine sulfoxide reductase  38.78 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0153224  normal  0.157322 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5092  methionine sulfoxide reductase A  42.47 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5180  methionine sulfoxide reductase A  42.47 
 
 		 171 aa  115  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.643562  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1241  peptide methionine sulfoxide reductase MsrA  38.67 
 
 		 176 aa  115  3e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00589693  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08631  peptide methionine sulfoxide reductase  37.58 
 
 		 179 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.442698  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0406  peptide methionine sulfoxide reductase  44.03 
 
 		 225 aa  115  3e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5471  methionine sulfoxide reductase A  41.78 
 
 		 171 aa  114  3.9999999999999997e-25  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3456  methionine sulfoxide reductase A  39.07 
 
 		 173 aa  114  5e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371606  hitchhiker  0.00394331 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4210  peptide methionine sulfoxide reductase  42.21 
 
 		 179 aa  114  5e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1949  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  40.52 
 
 		 351 aa  114  5e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00200432  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1308  peptide methionine sulfoxide reductase  41.45 
 
 		 184 aa  114  5e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0264  peptide methionine sulfoxide reductase  39.86 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2948  bifunctional methionine sulfoxide reductase B/A protein  39.35 
 
 		 322 aa  113  7.999999999999999e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1095  peptide methionine sulfoxide reductase  42.66 
 
 		 178 aa  113  8.999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1107  peptide methionine sulfoxide reductase  37.5 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.704075  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5709  methionine sulfoxide reductase A  41.18 
 
 		 169 aa  113  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.182189  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4604  methionine sulfoxide reductase A  40.27 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.982342  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4419  methionine sulfoxide reductase A  45.39 
 
 		 215 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2864  methionine sulfoxide reductase A  41.22 
 
 		 197 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1809  peptide methionine sulfoxide reductase  37.84 
 
 		 157 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.820755  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6018  methionine sulfoxide reductase A  39.07 
 
 		 172 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0078958 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0822  methionine sulfoxide reductase A  39.33 
 
 		 166 aa  112  3e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1044  peptide methionine sulfoxide reductase  39.19 
 
 		 211 aa  111  3e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.128569  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>