97 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_0805 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 86 aa  152  1e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  60.47 
 
 		 84 aa  86.7  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  59.3 
 
 		 84 aa  82  0.000000000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  57.32 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  50 
 
 		 84 aa  76.6  0.00000000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 84 aa  77  0.00000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 84 aa  76.6  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 		 84 aa  75.9  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 83 aa  73.2  0.000000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  58.44 
 
 		 84 aa  70.5  0.000000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 		 79 aa  70.5  0.000000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  57.14 
 
 		 84 aa  69.7  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  55.56 
 
 		 323 aa  69.3  0.00000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  56.79 
 
 		 117 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  60.49 
 
 		 116 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  55.56 
 
 		 115 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  56.79 
 
 		 84 aa  67.8  0.00000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 80 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  56.79 
 
 		 83 aa  67  0.00000000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  58.44 
 
 		 77 aa  66.2  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 88 aa  63.9  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  54.29 
 
 		 81 aa  63.5  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  51.32 
 
 		 78 aa  62.8  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  52.78 
 
 		 85 aa  62.8  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  50.65 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 88 aa  56.6  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  51.16 
 
 		 84 aa  56.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  44.74 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  52.4  0.000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 		 89 aa  52  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  41.03 
 
 		 86 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 88 aa  51.2  0.000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  50.8  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  50.4  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  40.96 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  41.98 
 
 		 83 aa  50.1  0.000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  40.96 
 
 		 84 aa  50.4  0.000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  42.31 
 
 		 84 aa  50.1  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  44.44 
 
 		 95 aa  49.7  0.00001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  41.03 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  41.03 
 
 		 84 aa  49.7  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  36.78 
 
 		 92 aa  47.8  0.00005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 		 84 aa  47.8  0.00006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  43.55 
 
 		 86 aa  45.8  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  40.26 
 
 		 84 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 96 aa  45.1  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 86 aa  44.3  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 90 aa  44.3  0.0005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  47.5 
 
 		 79 aa  44.7  0.0005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  38.89 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.36 
 
 		 87 aa  43.5  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 82 aa  43.1  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  44.9 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  44.9 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  37.66 
 
 		 82 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 82 aa  42  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  37.66 
 
 		 82 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 96 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  38.67 
 
 		 83 aa  42  0.003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  40.51 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  38.16 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 83 aa  40.8  0.006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2498  Transglycosylase-associated protein  44.29 
 
 		 86 aa  40.8  0.006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0602129 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  39.76 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  41.79 
 
 		 85 aa  40.4  0.009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 89 aa  40  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>