91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3185 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
88 aa  154  5.0000000000000005e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  67.05 
 
 
82 aa  103  9e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  65.12 
 
 
90 aa  100  5e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 
88 aa  94.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  60.23 
 
 
83 aa  92.4  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  60.23 
 
 
83 aa  89.4  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  54.55 
 
 
88 aa  82.8  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  45.65 
 
 
92 aa  77.8  0.00000000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  48.31 
 
 
85 aa  73.6  0.0000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 
85 aa  72.8  0.000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
89 aa  57.4  0.00000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
83 aa  56.6  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  39.29 
 
 
323 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  53.85 
 
 
84 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
80 aa  54.7  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  44.71 
 
 
88 aa  54.3  0.0000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
80 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
86 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
86 aa  52.8  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
83 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  45.35 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  45.35 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  38.37 
 
 
87 aa  49.7  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
82 aa  49.7  0.00001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 
84 aa  49.3  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  45.88 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 
83 aa  48.9  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  43.68 
 
 
82 aa  48.1  0.00004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  40.91 
 
 
84 aa  48.1  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
80 aa  47.4  0.00007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
86 aa  47  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 
86 aa  46.2  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
86 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.1 
 
 
101 aa  45.1  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  39.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  39.29 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  37.35 
 
 
83 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  37.35 
 
 
83 aa  43.9  0.0006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 
78 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  48.94 
 
 
83 aa  43.5  0.0009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0486  Transglycosylase-associated protein  40.45 
 
 
88 aa  43.5  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  38.82 
 
 
86 aa  43.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  35.23 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  43.53 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  37.65 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  47.62 
 
 
85 aa  42  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  42.68 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  39.76 
 
 
115 aa  42  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  42  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
84 aa  42  0.003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  43.48 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  38.55 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  39.76 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
83 aa  41.2  0.005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  39.76 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  39.76 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  39.76 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  39.76 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  36.36 
 
 
82 aa  40.8  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  37.36 
 
 
82 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 
96 aa  40  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  42.86 
 
 
87 aa  40  0.01  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>