84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_3708 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 103 aa  199  8e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  47.62 
 
 		 88 aa  72.4  0.000000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  49.33 
 
 		 85 aa  64.3  0.0000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 		 85 aa  63.2  0.000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  48.15 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  48.1 
 
 		 82 aa  62  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  41.24 
 
 		 101 aa  61.2  0.000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 90 aa  60.8  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 86 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  44.32 
 
 		 83 aa  57  0.00000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  48.68 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  37.93 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  42.05 
 
 		 88 aa  54.7  0.0000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  37.93 
 
 		 84 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3537  Transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 91 aa  53.5  0.0000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.796504  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 		 84 aa  52.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 		 89 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 82 aa  53.1  0.000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 		 92 aa  52.4  0.000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  43.21 
 
 		 82 aa  52  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  41.89 
 
 		 80 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  43.59 
 
 		 83 aa  52  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  41.11 
 
 		 88 aa  52  0.000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 96 aa  51.2  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 92 aa  51.2  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 84 aa  50.8  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 		 79 aa  50.4  0.000007  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  43.06 
 
 		 80 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 		 79 aa  50.1  0.00001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  39.33 
 
 		 83 aa  49.7  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 88 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  39.74 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  35.9 
 
 		 323 aa  48.1  0.00004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 88 aa  48.1  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  41.25 
 
 		 89 aa  47.8  0.00005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  36.59 
 
 		 87 aa  47.4  0.00006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  43.1 
 
 		 101 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  35.44 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 83 aa  45.4  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  40.85 
 
 		 87 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 84 aa  45.1  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  36.71 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  34.57 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  34.57 
 
 		 86 aa  44.3  0.0006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 80 aa  43.9  0.0007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  36.71 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  31.43 
 
 		 85 aa  43.9  0.0008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  36.05 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 82 aa  43.5  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 80 aa  42.7  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  35.44 
 
 		 82 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  35.29 
 
 		 87 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  35.8 
 
 		 87 aa  42  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0039  transglycosylase-associated protein  35.37 
 
 		 84 aa  42  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  32.5 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  33.33 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0261  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 87 aa  41.2  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  37.18 
 
 		 82 aa  40.4  0.008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>