48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_0350 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
83 aa  150  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  63.86 
 
 
83 aa  90.1  1e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 
83 aa  81.3  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 
84 aa  78.6  0.00000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  55.13 
 
 
83 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  53.01 
 
 
84 aa  70.9  0.000000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  58.82 
 
 
83 aa  69.3  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 
82 aa  68.9  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  54.41 
 
 
83 aa  67.8  0.00000000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  58.82 
 
 
82 aa  67.8  0.00000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  48.1 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  48.15 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  55.56 
 
 
85 aa  64.7  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  48.44 
 
 
84 aa  64.3  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  47.56 
 
 
96 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
103 aa  61.2  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  53.97 
 
 
85 aa  60.8  0.000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 
96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  59.26 
 
 
83 aa  57  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  40.74 
 
 
82 aa  50.8  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  45.33 
 
 
84 aa  50.8  0.000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 
92 aa  50.4  0.000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  36.36 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  40 
 
 
83 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  42.25 
 
 
80 aa  47  0.00009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
84 aa  45.4  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  44.32 
 
 
88 aa  44.7  0.0004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  36.59 
 
 
101 aa  44.3  0.0005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
84 aa  44.7  0.0005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  41.67 
 
 
88 aa  44.3  0.0006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 
82 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  52.08 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  37.18 
 
 
84 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  41.94 
 
 
87 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  37.18 
 
 
323 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  54.17 
 
 
80 aa  42.4  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 
90 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  52.08 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  39.74 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  40.23 
 
 
88 aa  42  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
86 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  37.18 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  34.85 
 
 
85 aa  40.4  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2498  Transglycosylase-associated protein  39.13 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0602129 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>