59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_0493 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
83 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  78.31 
 
 
83 aa  124  4.0000000000000003e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  80.3 
 
 
83 aa  101  3e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  61.45 
 
 
83 aa  98.2  4e-20  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  81.03 
 
 
82 aa  93.6  8e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  59.52 
 
 
84 aa  91.7  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  57.83 
 
 
83 aa  90.5  8e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  76.27 
 
 
83 aa  86.3  1e-16  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  62.9 
 
 
85 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 
83 aa  77.4  0.00000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  59.68 
 
 
85 aa  74.7  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  60.71 
 
 
84 aa  74.3  0.0000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
82 aa  73.9  0.0000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 
82 aa  73.2  0.000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
84 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 
83 aa  63.5  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  46.25 
 
 
96 aa  61.6  0.000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  53.97 
 
 
80 aa  57.4  0.00000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  40 
 
 
96 aa  57  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
92 aa  56.2  0.0000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  43.21 
 
 
82 aa  53.9  0.0000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
84 aa  49.7  0.00001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  39.73 
 
 
103 aa  50.1  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  45.24 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 
80 aa  47.8  0.00005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  43.84 
 
 
80 aa  47.8  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  44.16 
 
 
84 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  47.83 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  41.56 
 
 
84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  44.44 
 
 
87 aa  44.3  0.0006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  40.79 
 
 
88 aa  43.9  0.0007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  38.24 
 
 
101 aa  43.5  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3029  transglycosylase-associated protein  32.86 
 
 
87 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.808586 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 
83 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 
88 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.59 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  41.43 
 
 
83 aa  41.6  0.004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  41.38 
 
 
85 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  35.53 
 
 
79 aa  41.2  0.005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  48 
 
 
88 aa  41.2  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  40.28 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  47.62 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  48.94 
 
 
83 aa  40.8  0.007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
86 aa  40.4  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  33.73 
 
 
323 aa  40.4  0.009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>