34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3340 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  100 
 
 		 83 aa  148  3e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  91.04 
 
 		 83 aa  111  3e-24  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  80.6 
 
 		 83 aa  103  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  56.63 
 
 		 83 aa  93.6  7e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  59.04 
 
 		 84 aa  93.6  8e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  74.24 
 
 		 82 aa  93.2  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 83 aa  82.8  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  71.19 
 
 		 83 aa  81.3  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  66.13 
 
 		 85 aa  80.5  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  52.5 
 
 		 82 aa  79.7  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  61.45 
 
 		 84 aa  77.4  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  64.52 
 
 		 85 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 		 82 aa  77.4  0.00000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  58.33 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  52.56 
 
 		 84 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  55.13 
 
 		 83 aa  62.8  0.000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  41.98 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 96 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  49.21 
 
 		 80 aa  50.8  0.000006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 92 aa  50.1  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  33.75 
 
 		 96 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  44.12 
 
 		 101 aa  45.4  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 84 aa  44.7  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  41.07 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  41.67 
 
 		 84 aa  44.3  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40.28 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  42.47 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  47.69 
 
 		 80 aa  40.8  0.006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  39.76 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  35.71 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  44.12 
 
 		 83 aa  40  0.01  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>