39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_2513 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 83 aa  145  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  55.42 
 
 		 84 aa  78.2  0.00000000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  58.33 
 
 		 83 aa  75.9  0.0000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  50.62 
 
 		 82 aa  72  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0350  transglycosylase-associated protein  63.86 
 
 		 83 aa  71.6  0.000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.522608 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  48.15 
 
 		 82 aa  69.7  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  51.85 
 
 		 83 aa  66.2  0.0000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  42.31 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2654  transglycosylase-associated protein  55.88 
 
 		 83 aa  65.9  0.0000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.299446  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4169  transglycosylase-associated protein  55.07 
 
 		 82 aa  65.9  0.0000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 		 84 aa  65.1  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0493  transglycosylase-associated protein  52.24 
 
 		 83 aa  63.2  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0964  hypothetical protein  50.79 
 
 		 83 aa  58.9  0.00000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  46.84 
 
 		 84 aa  53.9  0.0000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 		 96 aa  53.5  0.0000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  42.86 
 
 		 101 aa  52.8  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3895  transglycosylase-associated protein  30 
 
 		 92 aa  51.6  0.000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.720352  normal  0.338294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  43.42 
 
 		 88 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  39.51 
 
 		 82 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 85 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 90 aa  48.9  0.00003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  37.33 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  37.33 
 
 		 86 aa  47.8  0.00006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  43.28 
 
 		 80 aa  47.4  0.00006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 		 83 aa  47  0.00009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4744  Transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  48.94 
 
 		 88 aa  43.5  0.0009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  34.18 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  31.58 
 
 		 323 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  52.5 
 
 		 87 aa  42.7  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 		 80 aa  42  0.003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  34.15 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  36.49 
 
 		 79 aa  40.8  0.007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  45.59 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>