93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0469 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 88 aa  160  7e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  63.33 
 
 		 90 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 		 88 aa  94.7  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  61.18 
 
 		 82 aa  89.7  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  54.02 
 
 		 88 aa  82.8  0.000000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 		 83 aa  78.6  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  51.16 
 
 		 83 aa  79  0.00000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  50 
 
 		 85 aa  78.6  0.00000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  51.14 
 
 		 85 aa  77.4  0.00000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  52.73 
 
 		 84 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 		 83 aa  58.2  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 89 aa  56.6  0.0000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 92 aa  54.3  0.0000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  38.55 
 
 		 323 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  41.11 
 
 		 103 aa  52  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 86 aa  51.2  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 86 aa  50.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  43.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 84 aa  49.3  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  43.53 
 
 		 83 aa  48.9  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 80 aa  49.3  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  39.02 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 84 aa  48.5  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  46.15 
 
 		 88 aa  48.5  0.00003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  39.29 
 
 		 86 aa  48.9  0.00003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.74 
 
 		 89 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 80 aa  48.5  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  37.35 
 
 		 84 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3969  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 		 85 aa  48.1  0.00004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.709132  normal  0.0745804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  38.1 
 
 		 84 aa  48.1  0.00004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 		 84 aa  47.4  0.00008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 84 aa  47  0.00009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  37.8 
 
 		 82 aa  46.2  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  40.91 
 
 		 84 aa  46.6  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  36.14 
 
 		 84 aa  46.2  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  33.73 
 
 		 86 aa  46.6  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  39.02 
 
 		 83 aa  45.8  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3560  hypothetical protein  42.67 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  36.9 
 
 		 83 aa  45.1  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  41.38 
 
 		 84 aa  45.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  40.23 
 
 		 87 aa  44.3  0.0005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5929  hypothetical protein  32.56 
 
 		 83 aa  44.3  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  43.9 
 
 		 80 aa  43.1  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4705  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 		 83 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0185222 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 		 83 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 80 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  40.48 
 
 		 83 aa  42  0.003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  35.59 
 
 		 86 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4202  Transglycosylase-associated protein  34.88 
 
 		 83 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0537626 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4026  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.846524  normal  0.495041 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4484  transglycosylase-associated protein  35.63 
 
 		 84 aa  41.2  0.004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.909812  normal  0.856161 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 		 84 aa  41.2  0.005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2936  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 90 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  42.68 
 
 		 88 aa  41.2  0.005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  38.27 
 
 		 82 aa  41.2  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  31.82 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1064  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6423e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  36.78 
 
 		 82 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0892  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.8  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  34.94 
 
 		 83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  39.77 
 
 		 84 aa  40.4  0.009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  34.15 
 
 		 82 aa  40.4  0.009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>