20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4346 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 92 aa  179  1e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  45.65 
 
 		 88 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  38.2 
 
 		 90 aa  67  0.00000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 		 82 aa  66.6  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  41.3 
 
 		 83 aa  65.1  0.0000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  39.77 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  43.01 
 
 		 83 aa  60.5  0.000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  36.96 
 
 		 88 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 		 88 aa  54.3  0.0000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  36.25 
 
 		 103 aa  51.2  0.000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  35.87 
 
 		 84 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 86 aa  46.2  0.0002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 		 86 aa  45.4  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  53.19 
 
 		 85 aa  45.1  0.0003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  44.44 
 
 		 89 aa  43.5  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  31.76 
 
 		 83 aa  43.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  35.62 
 
 		 86 aa  42.4  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  25.88 
 
 		 323 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  48.78 
 
 		 88 aa  41.6  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>