72 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0470 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  100 
 
 
90 aa  170  5.999999999999999e-42  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  65.12 
 
 
88 aa  100  5e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  63.33 
 
 
88 aa  100  7e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  65.12 
 
 
82 aa  94.7  3e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  58.43 
 
 
88 aa  90.1  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  51.11 
 
 
85 aa  82  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
85 aa  80.5  0.000000000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  52.33 
 
 
83 aa  77.8  0.00000000000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  54.65 
 
 
83 aa  76.6  0.0000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  38.2 
 
 
92 aa  67  0.00000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2251  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
89 aa  62  0.000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0500758  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  44.83 
 
 
103 aa  60.8  0.000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  42.05 
 
 
88 aa  58.9  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  52.17 
 
 
84 aa  55.5  0.0000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 
83 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  43.02 
 
 
82 aa  53.5  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  40.96 
 
 
82 aa  52.4  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0433  hypothetical protein  39.24 
 
 
83 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.515021  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0423  hypothetical protein  39.24 
 
 
83 aa  52  0.000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.407263  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1980  transglycosylase-associated protein  37.65 
 
 
82 aa  51.2  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2013  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  41.98 
 
 
80 aa  50.1  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2694  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
80 aa  49.7  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.975215  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3146  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000177868  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3381  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3162  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00262305  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3056  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000292001  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3382  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0674128  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
83 aa  48.9  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3411  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.9  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.627369  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3356  hypothetical protein  34.48 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1870  hypothetical protein  36.14 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 
86 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 
86 aa  47.8  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  38.82 
 
 
80 aa  46.6  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1676  Transglycosylase-associated protein  31.76 
 
 
84 aa  43.9  0.0008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  36.96 
 
 
87 aa  43.1  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1082  transglycosylase-associated protein  37.5 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.53675  normal  0.882525 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1629  transglycosylase-associated protein  34.94 
 
 
83 aa  43.5  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  38.55 
 
 
83 aa  43.1  0.001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  39.76 
 
 
84 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  39.33 
 
 
84 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3381  hypothetical protein  31.76 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.470225  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  32.18 
 
 
86 aa  42  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  43.59 
 
 
87 aa  42  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 
84 aa  42  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6612  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
89 aa  42  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.886558  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 
84 aa  41.6  0.003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  32.18 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  37.35 
 
 
96 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  45.31 
 
 
101 aa  41.2  0.005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0899  transglycosylase-associated protein  32.93 
 
 
83 aa  40.8  0.006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  34.52 
 
 
80 aa  40.8  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  32.14 
 
 
87 aa  40.4  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3340  hypothetical protein  35.71 
 
 
83 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.679831  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1901  Transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 
90 aa  40.4  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.780516  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0892  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2122  hypothetical protein  42.53 
 
 
82 aa  40.4  0.008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1064  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6423e-37 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4274  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.126831  hitchhiker  0.00313613 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0909  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000195971  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0988  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1028  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1155  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0924  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
85 aa  40.4  0.009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1082  hypothetical protein  32.93 
 
 
83 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
80 aa  40.4  0.009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0789  Transglycosylase-associated protein  41.33 
 
 
85 aa  40  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40.96 
 
 
101 aa  40  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>