85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_3806 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3806  transglycosylase-associated protein  100 
 
 		 86 aa  164  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1077  transglycosylase-associated protein  94.19 
 
 		 86 aa  155  1e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4838  hypothetical protein  51.69 
 
 		 87 aa  76.3  0.0000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34490  predicted membrane protein  48.28 
 
 		 87 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0974959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1375  Transglycosylase-associated protein  44.05 
 
 		 83 aa  61.6  0.000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.146111  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2587  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 		 82 aa  61.6  0.000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  40 
 
 		 85 aa  60.8  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  45.78 
 
 		 86 aa  60.1  0.000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  45.78 
 
 		 84 aa  60.1  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  44.58 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1353  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  59.3  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1341  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1298  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01180  hypothetical protein  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.580225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01170  predicted inner membrane protein  42.86 
 
 		 84 aa  58.5  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.641296  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 83 aa  58.5  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  45.78 
 
 		 82 aa  58.5  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2357  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  43.37 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  58.2  0.00000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  36.47 
 
 		 85 aa  57.4  0.00000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2453  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  56.6  0.0000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0124924  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2774  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 86 aa  56.2  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  44.58 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 103 aa  56.2  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  42.17 
 
 		 82 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1481  Transglycosylase-associated protein  38.37 
 
 		 86 aa  53.1  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3185  transglycosylase-associated protein  39.29 
 
 		 88 aa  53.1  0.000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15410  predicted membrane protein  37.65 
 
 		 88 aa  52.8  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0154975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 83 aa  53.1  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4749  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 82 aa  52.8  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.36707  normal  0.0857204 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  42.86 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  38.1 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  38.1 
 
 		 86 aa  48.5  0.00003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0122  Transglycosylase-associated protein  42.11 
 
 		 87 aa  48.1  0.00004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3646  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.117093  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 87 aa  47.4  0.00007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  42.53 
 
 		 80 aa  47.4  0.00007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3772  hypothetical protein  34.88 
 
 		 88 aa  47  0.00008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1551  Transglycosylase-associated protein  39.08 
 
 		 93 aa  47  0.00009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.551457  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3704  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0629843  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  39.53 
 
 		 85 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  32.94 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  43.42 
 
 		 323 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  42.17 
 
 		 83 aa  46.6  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 		 89 aa  45.8  0.0002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0469  transglycosylase-associated protein  32.53 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3787  hypothetical protein  37.93 
 
 		 88 aa  46.2  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0555258  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  49.18 
 
 		 82 aa  45.8  0.0002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4346  transglycosylase-associated protein  33.33 
 
 		 92 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0134878 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  38.55 
 
 		 83 aa  45.4  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3521  hypothetical protein  45.9 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000254441  normal  0.629824 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2225  Transglycosylase-associated protein  44.58 
 
 		 82 aa  44.3  0.0005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.956968  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  42.86 
 
 		 84 aa  43.5  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5891  Transglycosylase-associated protein  37.08 
 
 		 88 aa  42.7  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3822  transglycosylase-associated protein  33.71 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0470364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2554  hypothetical protein  44.26 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  40.7 
 
 		 84 aa  42.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  38.55 
 
 		 84 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  34.48 
 
 		 85 aa  42.7  0.002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2247  hypothetical protein  44.26 
 
 		 82 aa  42.7  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0470  transglycosylase-associated protein  32.18 
 
 		 90 aa  42  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3477  hypothetical protein  38.37 
 
 		 89 aa  41.6  0.003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  40.48 
 
 		 83 aa  41.2  0.005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  41.67 
 
 		 84 aa  40.8  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2422  transglycosylase-associated protein  32.94 
 
 		 88 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.161789  normal  0.103192 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>