144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1710b_3035 on replicon NC_007434
Organism: Burkholderia pseudomallei 1710b



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  100 
 
 
323 aa  638    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0149  hypothetical protein  99.13 
 
 
115 aa  224  2e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1601  transglycosylase associated protein family  97.17 
 
 
117 aa  200  3e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2627  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0781303  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2932  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235775  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2995  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.401136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  87.88 
 
 
116 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  91.57 
 
 
84 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  91.57 
 
 
84 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  91.57 
 
 
84 aa  139  6e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  86.75 
 
 
83 aa  135  6.0000000000000005e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  78.05 
 
 
84 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  78.05 
 
 
84 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  78.31 
 
 
84 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  77.11 
 
 
84 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0873  transglycosylase-associated protein  90.36 
 
 
84 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0885  transglycosylase-associated protein  90.36 
 
 
84 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0688857  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  68.18 
 
 
88 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0997  hypothetical protein  100 
 
 
77 aa  108  1e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.548684  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  71.6 
 
 
84 aa  107  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  61.54 
 
 
80 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
84 aa  95.1  1e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  58.23 
 
 
84 aa  94.7  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  55.7 
 
 
84 aa  94  3e-18  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  55.84 
 
 
79 aa  91.3  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  51.95 
 
 
79 aa  91.3  2e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  51.25 
 
 
83 aa  89.4  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1287  transglycosylase-associated protein  54.43 
 
 
80 aa  85.5  0.000000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.674553  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  56.06 
 
 
95 aa  82.4  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3681  transglycosylase-associated protein  49.37 
 
 
80 aa  80.1  0.00000000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  56.96 
 
 
84 aa  79.3  0.00000000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2918  transglycosylase-associated protein  62.5 
 
 
81 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  55.7 
 
 
84 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11889  transmembrane protein  40 
 
 
101 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.339875 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1208  transglycosylase-associated protein  53.85 
 
 
79 aa  70.5  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000243492  normal  0.0290476 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2064  hypothetical protein  47.44 
 
 
84 aa  70.5  0.00000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.109177  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3969  Transglycosylase-associated protein  44.71 
 
 
83 aa  70.1  0.00000000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1658  hypothetical protein  43.75 
 
 
82 aa  68.2  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1196  transglycosylase-associated protein  57.69 
 
 
78 aa  68.2  0.0000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.537861  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1564  Transglycosylase-associated protein  45.12 
 
 
83 aa  66.6  0.0000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.086703  normal  0.0617914 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3061  hypothetical protein  46.75 
 
 
82 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1365  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.578164 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1905  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.117408  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1398  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.207389 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2085  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000229735 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1381  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  66.2  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.166509  hitchhiker  0.0000279268 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2011  Transglycosylase-associated protein  52.54 
 
 
85 aa  65.9  0.0000000008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.656873  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0860  transglycosylase-associated protein  50.77 
 
 
85 aa  65.5  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.145292 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1988  transglycosylase-associated protein  51.28 
 
 
79 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.928213  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2800  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3529  transglycosylase-associated protein  38.46 
 
 
80 aa  63.2  0.000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1346  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.96437  normal  0.0395019 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2879  hypothetical protein  40 
 
 
82 aa  63.2  0.000000006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0433  transglycosylase-associated protein, putative  43.84 
 
 
86 aa  63.2  0.000000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0440  putative transglycosylase-associated protein  43.84 
 
 
86 aa  63.2  0.000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  40.24 
 
 
85 aa  62.4  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0566  Transglycosylase-associated protein  49.38 
 
 
83 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.644317  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03066  hypothetical protein  41.77 
 
 
83 aa  61.6  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3708  Transglycosylase-associated protein  35.9 
 
 
103 aa  61.6  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0953333  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1625  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
84 aa  61.2  0.00000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.212746  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  36.36 
 
 
85 aa  59.7  0.00000007  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  39.74 
 
 
84 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  39.74 
 
 
84 aa  59.3  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0544  transglycosylase-associated protein  40.54 
 
 
87 aa  59.3  0.00000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.488698  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  58.02 
 
 
86 aa  58.5  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3344  transglycosylase-associated protein  46.43 
 
 
100 aa  58.5  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.121205 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3902  transglycosylase-associated protein  41.46 
 
 
85 aa  58.9  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5923  transglycosylase-associated protein  44.87 
 
 
96 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.227403  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03247  transglycosylase associated protein  40.96 
 
 
83 aa  58.9  0.0000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1610  Transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 
82 aa  58.2  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6532  Transglycosylase-associated protein  44 
 
 
96 aa  57.4  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0639472  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1803  Transglycosylase-associated protein  35.44 
 
 
82 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  hitchhiker  0.00727538  hitchhiker  0.00221721 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3074  transglycosylase-associated protein  38.71 
 
 
101 aa  56.2  0.0000007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.270595  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0123  transglycosylase-associated protein  51.43 
 
 
84 aa  56.2  0.0000007  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1935  transglycosylase associated protein  48.35 
 
 
86 aa  56.2  0.0000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.261097  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2513  transglycosylase-associated protein  34.21 
 
 
83 aa  55.5  0.000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.855723  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3901  transglycosylase-associated protein  37.21 
 
 
85 aa  55.8  0.000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1818  Transglycosylase-associated protein  42.42 
 
 
84 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0629036  decreased coverage  0.000804955 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1939  transglycosylase-associated protein  48.86 
 
 
84 aa  53.9  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.194115  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1472  Transglycosylase-associated protein  57.58 
 
 
86 aa  54.3  0.000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.434508  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01764  conserved inner membrane protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.566585  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1848  Transglycosylase-associated protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01752  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.413898  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2520  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.94994 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1882  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2020  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000134501  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1838  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.279236 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1395  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.669692  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2049  hypothetical protein  45 
 
 
82 aa  53.9  0.000004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.934268  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4137  Transglycosylase-associated protein  50.63 
 
 
84 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0915055  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1995  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 
84 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1336  transglycosylase associated protein  47.73 
 
 
84 aa  53.5  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.113513  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  50 
 
 
86 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
86 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1521  transglycosylase-associated protein  47.73 
 
 
84 aa  53.1  0.000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.663718  normal  0.989429 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6259  hypothetical protein  47.06 
 
 
81 aa  52.8  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.196091  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  45.45 
 
 
89 aa  52  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0970  hypothetical protein  38.67 
 
 
83 aa  52  0.00001  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0316275  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1953  transglycosylase-associated protein  49.43 
 
 
84 aa  52.4  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.122238  normal  0.144892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2430  transglycosylase-associated protein  48.28 
 
 
84 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.889606  normal  0.349986 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>