31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1609 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_1802  hypothetical protein  100 
 
 
84 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.020628  hitchhiker  0.0021209 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1609  conserved hypothetical conserved membrane protein  100 
 
 
84 aa  149  1e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0221  transglycosylase-associated protein  46.99 
 
 
84 aa  62  0.000000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.418922 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1065  transglycosylase-associated protein  45.24 
 
 
84 aa  56.6  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1768  hypothetical protein  47.62 
 
 
84 aa  54.3  0.0000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.261316  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3017  hypothetical protein  48 
 
 
95 aa  54.3  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.414753 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4273  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.170757  normal  0.320296 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4161  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
84 aa  50.4  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.728157  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0533  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0753547  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1012  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00257651  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3035  hypothetical protein  37.18 
 
 
323 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.34163  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0972  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
84 aa  48.9  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.323541  normal  0.151921 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2385  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
83 aa  48.5  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3296  transglycosylase-associated protein  44 
 
 
85 aa  48.5  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.710907  normal  0.391703 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4325  transglycosylase-associated protein  41.18 
 
 
88 aa  48.1  0.00004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.91454 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1911  transglycosylase-associated protein  43.04 
 
 
84 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.233889  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4801  Transglycosylase-associated protein  43.21 
 
 
84 aa  47  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0273667  hitchhiker  0.00017828 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3461  transglycosylase-associated protein  41.77 
 
 
84 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.131204  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1859  hypothetical protein  43.21 
 
 
84 aa  46.2  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.460466  normal  0.0773956 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2924  transglycosylase-associated protein  46.05 
 
 
79 aa  46.2  0.0002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.32188  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0805  transglycosylase-associated protein  42.47 
 
 
86 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1197  transglycosylase-associated protein  44.16 
 
 
79 aa  45.4  0.0003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.695505  normal  0.873941 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2685  transglycosylase-associated protein  39.51 
 
 
84 aa  44.7  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2963  transglycosylase-associated protein  36.59 
 
 
89 aa  43.1  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.38582  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1423  transglycosylase-associated protein  41.03 
 
 
85 aa  43.5  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0910  Transglycosylase-associated protein  44.74 
 
 
80 aa  42.7  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.410027  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2221  transglycosylase-associated protein  42.67 
 
 
89 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.024328  normal  0.535826 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0487  transglycosylase-associated protein  37.97 
 
 
83 aa  41.6  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000597853  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3814  transglycosylase-associated protein  51.02 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.781187  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0212  Transglycosylase-associated protein  51.02 
 
 
86 aa  41.6  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.349145  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4121  transglycosylase-associated protein  50 
 
 
116 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000759893  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>